Protein–RNA interactions for Protein: Q99700

ATXN2, Ataxin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN2Q99700 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATXN2Q99700 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATXN2Q99700 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATXN2Q99700 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATXN2Q99700 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATXN2Q99700 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATXN2Q99700 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATXN2Q99700 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATXN2Q99700 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATXN2Q99700 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATXN2Q99700 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATXN2Q99700 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATXN2Q99700 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATXN2Q99700 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATXN2Q99700 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATXN2Q99700 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATXN2Q99700 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATXN2Q99700 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATXN2Q99700 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATXN2Q99700 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATXN2Q99700 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATXN2Q99700 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATXN2Q99700 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATXN2Q99700 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATXN2Q99700 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATXN2Q99700 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ATXN2Q99700 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATXN2Q99700 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATXN2Q99700 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATXN2Q99700 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATXN2Q99700 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATXN2Q99700 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ATXN2Q99700 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ATXN2Q99700 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ATXN2Q99700 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ATXN2Q99700 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ATXN2Q99700 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ATXN2Q99700 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ATXN2Q99700 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ATXN2Q99700 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ATXN2Q99700 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ATXN2Q99700 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ATXN2Q99700 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ATXN2Q99700 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ATXN2Q99700 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATXN2Q99700 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATXN2Q99700 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATXN2Q99700 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATXN2Q99700 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ATXN2Q99700 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATXN2Q99700 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATXN2Q99700 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATXN2Q99700 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATXN2Q99700 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATXN2Q99700 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATXN2Q99700 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATXN2Q99700 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATXN2Q99700 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATXN2Q99700 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATXN2Q99700 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATXN2Q99700 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATXN2Q99700 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ATXN2Q99700 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ATXN2Q99700 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ATXN2Q99700 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATXN2Q99700 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATXN2Q99700 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATXN2Q99700 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ATXN2Q99700 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ATXN2Q99700 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ATXN2Q99700 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ATXN2Q99700 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ATXN2Q99700 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ATXN2Q99700 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ATXN2Q99700 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATXN2Q99700 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATXN2Q99700 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATXN2Q99700 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATXN2Q99700 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATXN2Q99700 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATXN2Q99700 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATXN2Q99700 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATXN2Q99700 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATXN2Q99700 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATXN2Q99700 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATXN2Q99700 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATXN2Q99700 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATXN2Q99700 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATXN2Q99700 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATXN2Q99700 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATXN2Q99700 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATXN2Q99700 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATXN2Q99700 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATXN2Q99700 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATXN2Q99700 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATXN2Q99700 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATXN2Q99700 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATXN2Q99700 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATXN2Q99700 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATXN2Q99700 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms