Protein–RNA interactions for Protein: Q99607

ELF4, ETS-related transcription factor Elf-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF4Q99607 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ELF4Q99607 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ELF4Q99607 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ELF4Q99607 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ELF4Q99607 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ELF4Q99607 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ELF4Q99607 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ELF4Q99607 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ELF4Q99607 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ELF4Q99607 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ELF4Q99607 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ELF4Q99607 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ELF4Q99607 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ELF4Q99607 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ELF4Q99607 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ELF4Q99607 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ELF4Q99607 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ELF4Q99607 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ELF4Q99607 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ELF4Q99607 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ELF4Q99607 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ELF4Q99607 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ELF4Q99607 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ELF4Q99607 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ELF4Q99607 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ELF4Q99607 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ELF4Q99607 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ELF4Q99607 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ELF4Q99607 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ELF4Q99607 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ELF4Q99607 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ELF4Q99607 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ELF4Q99607 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ELF4Q99607 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ELF4Q99607 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ELF4Q99607 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ELF4Q99607 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ELF4Q99607 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ELF4Q99607 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ELF4Q99607 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ELF4Q99607 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ELF4Q99607 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ELF4Q99607 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ELF4Q99607 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ELF4Q99607 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ELF4Q99607 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ELF4Q99607 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ELF4Q99607 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ELF4Q99607 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ELF4Q99607 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ELF4Q99607 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ELF4Q99607 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ELF4Q99607 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ELF4Q99607 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ELF4Q99607 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ELF4Q99607 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ELF4Q99607 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ELF4Q99607 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ELF4Q99607 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ELF4Q99607 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ELF4Q99607 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ELF4Q99607 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ELF4Q99607 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ELF4Q99607 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ELF4Q99607 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ELF4Q99607 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ELF4Q99607 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ELF4Q99607 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ELF4Q99607 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ELF4Q99607 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ELF4Q99607 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ELF4Q99607 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ELF4Q99607 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ELF4Q99607 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ELF4Q99607 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ELF4Q99607 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ELF4Q99607 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ELF4Q99607 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ELF4Q99607 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ELF4Q99607 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ELF4Q99607 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ELF4Q99607 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ELF4Q99607 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ELF4Q99607 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ELF4Q99607 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ELF4Q99607 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ELF4Q99607 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ELF4Q99607 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ELF4Q99607 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ELF4Q99607 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ELF4Q99607 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ELF4Q99607 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ELF4Q99607 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ELF4Q99607 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ELF4Q99607 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ELF4Q99607 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ELF4Q99607 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ELF4Q99607 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ELF4Q99607 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ELF4Q99607 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms