Protein–RNA interactions for Protein: Q96RQ3

MCCC1, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCC1Q96RQ3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
MCCC1Q96RQ3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MCCC1Q96RQ3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MCCC1Q96RQ3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MCCC1Q96RQ3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MCCC1Q96RQ3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MCCC1Q96RQ3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MCCC1Q96RQ3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MCCC1Q96RQ3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MCCC1Q96RQ3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MCCC1Q96RQ3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MCCC1Q96RQ3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MCCC1Q96RQ3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
MCCC1Q96RQ3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MCCC1Q96RQ3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MCCC1Q96RQ3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MCCC1Q96RQ3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MCCC1Q96RQ3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MCCC1Q96RQ3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MCCC1Q96RQ3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
MCCC1Q96RQ3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MCCC1Q96RQ3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MCCC1Q96RQ3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MCCC1Q96RQ3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MCCC1Q96RQ3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MCCC1Q96RQ3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
MCCC1Q96RQ3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MCCC1Q96RQ3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MCCC1Q96RQ3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MCCC1Q96RQ3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MCCC1Q96RQ3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MCCC1Q96RQ3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MCCC1Q96RQ3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MCCC1Q96RQ3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
MCCC1Q96RQ3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MCCC1Q96RQ3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MCCC1Q96RQ3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MCCC1Q96RQ3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MCCC1Q96RQ3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MCCC1Q96RQ3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MCCC1Q96RQ3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MCCC1Q96RQ3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MCCC1Q96RQ3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MCCC1Q96RQ3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MCCC1Q96RQ3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MCCC1Q96RQ3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MCCC1Q96RQ3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MCCC1Q96RQ3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MCCC1Q96RQ3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MCCC1Q96RQ3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MCCC1Q96RQ3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MCCC1Q96RQ3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MCCC1Q96RQ3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MCCC1Q96RQ3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MCCC1Q96RQ3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MCCC1Q96RQ3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MCCC1Q96RQ3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MCCC1Q96RQ3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MCCC1Q96RQ3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MCCC1Q96RQ3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MCCC1Q96RQ3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MCCC1Q96RQ3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MCCC1Q96RQ3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MCCC1Q96RQ3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MCCC1Q96RQ3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MCCC1Q96RQ3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MCCC1Q96RQ3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MCCC1Q96RQ3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MCCC1Q96RQ3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MCCC1Q96RQ3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MCCC1Q96RQ3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
MCCC1Q96RQ3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MCCC1Q96RQ3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MCCC1Q96RQ3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCCC1Q96RQ3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCCC1Q96RQ3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCCC1Q96RQ3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCCC1Q96RQ3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCCC1Q96RQ3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCCC1Q96RQ3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCCC1Q96RQ3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCCC1Q96RQ3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCCC1Q96RQ3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCCC1Q96RQ3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCCC1Q96RQ3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCCC1Q96RQ3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCCC1Q96RQ3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCCC1Q96RQ3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCCC1Q96RQ3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
MCCC1Q96RQ3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCCC1Q96RQ3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCCC1Q96RQ3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCCC1Q96RQ3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCCC1Q96RQ3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCCC1Q96RQ3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCCC1Q96RQ3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCCC1Q96RQ3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MCCC1Q96RQ3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MCCC1Q96RQ3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MCCC1Q96RQ3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms