Protein–RNA interactions for Protein: Q96RJ6

FERD3L, Fer3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FERD3LQ96RJ6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FERD3LQ96RJ6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FERD3LQ96RJ6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FERD3LQ96RJ6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FERD3LQ96RJ6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FERD3LQ96RJ6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FERD3LQ96RJ6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FERD3LQ96RJ6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FERD3LQ96RJ6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
FERD3LQ96RJ6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FERD3LQ96RJ6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FERD3LQ96RJ6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FERD3LQ96RJ6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FERD3LQ96RJ6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FERD3LQ96RJ6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FERD3LQ96RJ6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FERD3LQ96RJ6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FERD3LQ96RJ6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FERD3LQ96RJ6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FERD3LQ96RJ6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
FERD3LQ96RJ6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FERD3LQ96RJ6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FERD3LQ96RJ6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FERD3LQ96RJ6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FERD3LQ96RJ6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FERD3LQ96RJ6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
FERD3LQ96RJ6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FERD3LQ96RJ6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
FERD3LQ96RJ6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FERD3LQ96RJ6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FERD3LQ96RJ6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FERD3LQ96RJ6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FERD3LQ96RJ6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
FERD3LQ96RJ6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FERD3LQ96RJ6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FERD3LQ96RJ6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FERD3LQ96RJ6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
FERD3LQ96RJ6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FERD3LQ96RJ6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FERD3LQ96RJ6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FERD3LQ96RJ6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FERD3LQ96RJ6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
FERD3LQ96RJ6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FERD3LQ96RJ6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FERD3LQ96RJ6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FERD3LQ96RJ6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FERD3LQ96RJ6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FERD3LQ96RJ6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FERD3LQ96RJ6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FERD3LQ96RJ6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FERD3LQ96RJ6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FERD3LQ96RJ6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FERD3LQ96RJ6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FERD3LQ96RJ6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FERD3LQ96RJ6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FERD3LQ96RJ6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FERD3LQ96RJ6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FERD3LQ96RJ6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FERD3LQ96RJ6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FERD3LQ96RJ6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FERD3LQ96RJ6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FERD3LQ96RJ6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FERD3LQ96RJ6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FERD3LQ96RJ6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FERD3LQ96RJ6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FERD3LQ96RJ6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FERD3LQ96RJ6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FERD3LQ96RJ6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FERD3LQ96RJ6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FERD3LQ96RJ6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FERD3LQ96RJ6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
FERD3LQ96RJ6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FERD3LQ96RJ6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FERD3LQ96RJ6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
FERD3LQ96RJ6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FERD3LQ96RJ6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FERD3LQ96RJ6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FERD3LQ96RJ6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FERD3LQ96RJ6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FERD3LQ96RJ6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
FERD3LQ96RJ6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FERD3LQ96RJ6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FERD3LQ96RJ6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FERD3LQ96RJ6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FERD3LQ96RJ6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FERD3LQ96RJ6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FERD3LQ96RJ6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FERD3LQ96RJ6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FERD3LQ96RJ6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FERD3LQ96RJ6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FERD3LQ96RJ6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FERD3LQ96RJ6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FERD3LQ96RJ6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FERD3LQ96RJ6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FERD3LQ96RJ6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FERD3LQ96RJ6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FERD3LQ96RJ6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FERD3LQ96RJ6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
FERD3LQ96RJ6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FERD3LQ96RJ6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms