Protein–RNA interactions for Protein: Q96PU5

NEDD4L, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4-like, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4LQ96PU5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEDD4LQ96PU5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEDD4LQ96PU5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEDD4LQ96PU5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEDD4LQ96PU5 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEDD4LQ96PU5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEDD4LQ96PU5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEDD4LQ96PU5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEDD4LQ96PU5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEDD4LQ96PU5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEDD4LQ96PU5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEDD4LQ96PU5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEDD4LQ96PU5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEDD4LQ96PU5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEDD4LQ96PU5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEDD4LQ96PU5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEDD4LQ96PU5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEDD4LQ96PU5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEDD4LQ96PU5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEDD4LQ96PU5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
NEDD4LQ96PU5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEDD4LQ96PU5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEDD4LQ96PU5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEDD4LQ96PU5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEDD4LQ96PU5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEDD4LQ96PU5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEDD4LQ96PU5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEDD4LQ96PU5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NEDD4LQ96PU5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEDD4LQ96PU5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEDD4LQ96PU5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEDD4LQ96PU5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEDD4LQ96PU5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEDD4LQ96PU5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEDD4LQ96PU5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEDD4LQ96PU5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEDD4LQ96PU5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NEDD4LQ96PU5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEDD4LQ96PU5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEDD4LQ96PU5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEDD4LQ96PU5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEDD4LQ96PU5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEDD4LQ96PU5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEDD4LQ96PU5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEDD4LQ96PU5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEDD4LQ96PU5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEDD4LQ96PU5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEDD4LQ96PU5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEDD4LQ96PU5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NEDD4LQ96PU5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEDD4LQ96PU5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NEDD4LQ96PU5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEDD4LQ96PU5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEDD4LQ96PU5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEDD4LQ96PU5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEDD4LQ96PU5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEDD4LQ96PU5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEDD4LQ96PU5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEDD4LQ96PU5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEDD4LQ96PU5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEDD4LQ96PU5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEDD4LQ96PU5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEDD4LQ96PU5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEDD4LQ96PU5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NEDD4LQ96PU5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEDD4LQ96PU5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEDD4LQ96PU5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEDD4LQ96PU5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEDD4LQ96PU5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEDD4LQ96PU5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NEDD4LQ96PU5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEDD4LQ96PU5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NEDD4LQ96PU5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEDD4LQ96PU5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEDD4LQ96PU5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEDD4LQ96PU5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEDD4LQ96PU5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEDD4LQ96PU5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEDD4LQ96PU5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEDD4LQ96PU5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEDD4LQ96PU5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEDD4LQ96PU5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEDD4LQ96PU5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEDD4LQ96PU5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEDD4LQ96PU5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEDD4LQ96PU5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEDD4LQ96PU5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEDD4LQ96PU5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEDD4LQ96PU5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEDD4LQ96PU5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEDD4LQ96PU5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEDD4LQ96PU5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEDD4LQ96PU5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEDD4LQ96PU5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEDD4LQ96PU5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEDD4LQ96PU5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEDD4LQ96PU5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEDD4LQ96PU5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEDD4LQ96PU5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEDD4LQ96PU5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms