Protein–RNA interactions for Protein: Q96NM4

TOX2, TOX high mobility group box family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOX2Q96NM4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TOX2Q96NM4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TOX2Q96NM4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TOX2Q96NM4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TOX2Q96NM4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TOX2Q96NM4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TOX2Q96NM4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TOX2Q96NM4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TOX2Q96NM4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
TOX2Q96NM4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TOX2Q96NM4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
TOX2Q96NM4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TOX2Q96NM4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TOX2Q96NM4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
TOX2Q96NM4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TOX2Q96NM4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TOX2Q96NM4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TOX2Q96NM4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TOX2Q96NM4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TOX2Q96NM4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TOX2Q96NM4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TOX2Q96NM4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TOX2Q96NM4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TOX2Q96NM4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TOX2Q96NM4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
TOX2Q96NM4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TOX2Q96NM4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TOX2Q96NM4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TOX2Q96NM4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TOX2Q96NM4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TOX2Q96NM4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TOX2Q96NM4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TOX2Q96NM4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TOX2Q96NM4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TOX2Q96NM4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TOX2Q96NM4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TOX2Q96NM4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TOX2Q96NM4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TOX2Q96NM4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TOX2Q96NM4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TOX2Q96NM4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TOX2Q96NM4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TOX2Q96NM4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TOX2Q96NM4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TOX2Q96NM4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TOX2Q96NM4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TOX2Q96NM4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TOX2Q96NM4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TOX2Q96NM4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
TOX2Q96NM4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TOX2Q96NM4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TOX2Q96NM4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TOX2Q96NM4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TOX2Q96NM4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TOX2Q96NM4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TOX2Q96NM4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
TOX2Q96NM4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TOX2Q96NM4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TOX2Q96NM4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TOX2Q96NM4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TOX2Q96NM4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TOX2Q96NM4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TOX2Q96NM4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
TOX2Q96NM4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TOX2Q96NM4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
TOX2Q96NM4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TOX2Q96NM4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TOX2Q96NM4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TOX2Q96NM4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TOX2Q96NM4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TOX2Q96NM4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TOX2Q96NM4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TOX2Q96NM4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TOX2Q96NM4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TOX2Q96NM4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TOX2Q96NM4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TOX2Q96NM4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TOX2Q96NM4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TOX2Q96NM4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TOX2Q96NM4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TOX2Q96NM4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TOX2Q96NM4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TOX2Q96NM4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TOX2Q96NM4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TOX2Q96NM4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TOX2Q96NM4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TOX2Q96NM4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TOX2Q96NM4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TOX2Q96NM4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TOX2Q96NM4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TOX2Q96NM4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TOX2Q96NM4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TOX2Q96NM4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TOX2Q96NM4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TOX2Q96NM4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TOX2Q96NM4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TOX2Q96NM4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TOX2Q96NM4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TOX2Q96NM4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TOX2Q96NM4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms