Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR9

APOLD1, Apolipoprotein L domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOLD1Q96LR9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
APOLD1Q96LR9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
APOLD1Q96LR9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
APOLD1Q96LR9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
APOLD1Q96LR9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
APOLD1Q96LR9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APOLD1Q96LR9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APOLD1Q96LR9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
APOLD1Q96LR9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
APOLD1Q96LR9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
APOLD1Q96LR9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
APOLD1Q96LR9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APOLD1Q96LR9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
APOLD1Q96LR9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
APOLD1Q96LR9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
APOLD1Q96LR9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
APOLD1Q96LR9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
APOLD1Q96LR9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
APOLD1Q96LR9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
APOLD1Q96LR9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
APOLD1Q96LR9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
APOLD1Q96LR9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
APOLD1Q96LR9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
APOLD1Q96LR9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
APOLD1Q96LR9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
APOLD1Q96LR9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
APOLD1Q96LR9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
APOLD1Q96LR9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
APOLD1Q96LR9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
APOLD1Q96LR9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
APOLD1Q96LR9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
APOLD1Q96LR9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
APOLD1Q96LR9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
APOLD1Q96LR9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOLD1Q96LR9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOLD1Q96LR9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOLD1Q96LR9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOLD1Q96LR9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOLD1Q96LR9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOLD1Q96LR9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOLD1Q96LR9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
APOLD1Q96LR9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
APOLD1Q96LR9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
APOLD1Q96LR9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOLD1Q96LR9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOLD1Q96LR9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
APOLD1Q96LR9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
APOLD1Q96LR9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
APOLD1Q96LR9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
APOLD1Q96LR9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
APOLD1Q96LR9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
APOLD1Q96LR9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
APOLD1Q96LR9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
APOLD1Q96LR9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
APOLD1Q96LR9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
APOLD1Q96LR9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
APOLD1Q96LR9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
APOLD1Q96LR9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
APOLD1Q96LR9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
APOLD1Q96LR9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
APOLD1Q96LR9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOLD1Q96LR9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOLD1Q96LR9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOLD1Q96LR9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOLD1Q96LR9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
APOLD1Q96LR9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOLD1Q96LR9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOLD1Q96LR9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOLD1Q96LR9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOLD1Q96LR9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOLD1Q96LR9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOLD1Q96LR9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
APOLD1Q96LR9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
APOLD1Q96LR9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
APOLD1Q96LR9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
APOLD1Q96LR9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
APOLD1Q96LR9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
APOLD1Q96LR9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
APOLD1Q96LR9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
APOLD1Q96LR9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
APOLD1Q96LR9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOLD1Q96LR9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOLD1Q96LR9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOLD1Q96LR9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
APOLD1Q96LR9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
APOLD1Q96LR9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
APOLD1Q96LR9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
APOLD1Q96LR9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
APOLD1Q96LR9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
APOLD1Q96LR9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
APOLD1Q96LR9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
APOLD1Q96LR9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
APOLD1Q96LR9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
APOLD1Q96LR9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
APOLD1Q96LR9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
APOLD1Q96LR9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
APOLD1Q96LR9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
APOLD1Q96LR9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
APOLD1Q96LR9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
APOLD1Q96LR9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.9 ms