Protein–RNA interactions for Protein: Q96KA5

CLPTM1L, Cleft lip and palate transmembrane protein 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPTM1LQ96KA5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLPTM1LQ96KA5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLPTM1LQ96KA5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLPTM1LQ96KA5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLPTM1LQ96KA5 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLPTM1LQ96KA5 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLPTM1LQ96KA5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLPTM1LQ96KA5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLPTM1LQ96KA5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLPTM1LQ96KA5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLPTM1LQ96KA5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLPTM1LQ96KA5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLPTM1LQ96KA5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLPTM1LQ96KA5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLPTM1LQ96KA5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLPTM1LQ96KA5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLPTM1LQ96KA5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLPTM1LQ96KA5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLPTM1LQ96KA5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLPTM1LQ96KA5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLPTM1LQ96KA5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLPTM1LQ96KA5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLPTM1LQ96KA5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLPTM1LQ96KA5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLPTM1LQ96KA5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLPTM1LQ96KA5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLPTM1LQ96KA5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLPTM1LQ96KA5 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLPTM1LQ96KA5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CLPTM1LQ96KA5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLPTM1LQ96KA5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLPTM1LQ96KA5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLPTM1LQ96KA5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLPTM1LQ96KA5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLPTM1LQ96KA5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLPTM1LQ96KA5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLPTM1LQ96KA5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLPTM1LQ96KA5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CLPTM1LQ96KA5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLPTM1LQ96KA5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLPTM1LQ96KA5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLPTM1LQ96KA5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLPTM1LQ96KA5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLPTM1LQ96KA5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLPTM1LQ96KA5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLPTM1LQ96KA5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLPTM1LQ96KA5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLPTM1LQ96KA5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CLPTM1LQ96KA5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLPTM1LQ96KA5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLPTM1LQ96KA5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CLPTM1LQ96KA5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLPTM1LQ96KA5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLPTM1LQ96KA5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLPTM1LQ96KA5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLPTM1LQ96KA5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLPTM1LQ96KA5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLPTM1LQ96KA5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLPTM1LQ96KA5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLPTM1LQ96KA5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLPTM1LQ96KA5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLPTM1LQ96KA5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLPTM1LQ96KA5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLPTM1LQ96KA5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLPTM1LQ96KA5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLPTM1LQ96KA5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLPTM1LQ96KA5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLPTM1LQ96KA5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLPTM1LQ96KA5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLPTM1LQ96KA5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CLPTM1LQ96KA5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLPTM1LQ96KA5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLPTM1LQ96KA5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLPTM1LQ96KA5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLPTM1LQ96KA5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLPTM1LQ96KA5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLPTM1LQ96KA5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLPTM1LQ96KA5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLPTM1LQ96KA5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLPTM1LQ96KA5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLPTM1LQ96KA5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLPTM1LQ96KA5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLPTM1LQ96KA5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLPTM1LQ96KA5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLPTM1LQ96KA5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLPTM1LQ96KA5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLPTM1LQ96KA5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CLPTM1LQ96KA5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLPTM1LQ96KA5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CLPTM1LQ96KA5 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLPTM1LQ96KA5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLPTM1LQ96KA5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLPTM1LQ96KA5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLPTM1LQ96KA5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLPTM1LQ96KA5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLPTM1LQ96KA5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLPTM1LQ96KA5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLPTM1LQ96KA5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLPTM1LQ96KA5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLPTM1LQ96KA5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms