Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
LRRIQ1Q96JM4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC39■■■■□ 3.83
LRRIQ1Q96JM4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC39■■■■□ 3.83
LRRIQ1Q96JM4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
LRRIQ1Q96JM4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC39■■■■□ 3.83
LRRIQ1Q96JM4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
LRRIQ1Q96JM4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.99■■■■□ 3.83
LRRIQ1Q96JM4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
LRRIQ1Q96JM4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
LRRIQ1Q96JM4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
LRRIQ1Q96JM4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC38.98■■■■□ 3.83
LRRIQ1Q96JM4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC38.98■■■■□ 3.83
LRRIQ1Q96JM4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC38.98■■■■□ 3.83
LRRIQ1Q96JM4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
LRRIQ1Q96JM4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
LRRIQ1Q96JM4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
LRRIQ1Q96JM4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC38.97■■■■□ 3.83
LRRIQ1Q96JM4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC38.97■■■■□ 3.83
LRRIQ1Q96JM4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
LRRIQ1Q96JM4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC38.97■■■■□ 3.83
LRRIQ1Q96JM4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC38.97■■■■□ 3.83
LRRIQ1Q96JM4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
LRRIQ1Q96JM4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
LRRIQ1Q96JM4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
LRRIQ1Q96JM4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC38.95■■■■□ 3.83
LRRIQ1Q96JM4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC38.95■■■■□ 3.83
LRRIQ1Q96JM4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC38.95■■■■□ 3.83
LRRIQ1Q96JM4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC38.95■■■■□ 3.83
LRRIQ1Q96JM4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
LRRIQ1Q96JM4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
LRRIQ1Q96JM4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
LRRIQ1Q96JM4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
LRRIQ1Q96JM4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
LRRIQ1Q96JM4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC38.92■■■■□ 3.82
LRRIQ1Q96JM4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.92■■■■□ 3.82
LRRIQ1Q96JM4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
LRRIQ1Q96JM4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.91■■■■□ 3.82
LRRIQ1Q96JM4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC38.9■■■■□ 3.82
LRRIQ1Q96JM4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
LRRIQ1Q96JM4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
LRRIQ1Q96JM4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC38.89■■■■□ 3.82
LRRIQ1Q96JM4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC38.89■■■■□ 3.82
LRRIQ1Q96JM4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC38.89■■■■□ 3.82
LRRIQ1Q96JM4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
LRRIQ1Q96JM4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.88■■■■□ 3.81
LRRIQ1Q96JM4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC38.88■■■■□ 3.81
LRRIQ1Q96JM4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC38.88■■■■□ 3.81
LRRIQ1Q96JM4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
LRRIQ1Q96JM4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC38.87■■■■□ 3.81
LRRIQ1Q96JM4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
LRRIQ1Q96JM4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
LRRIQ1Q96JM4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
LRRIQ1Q96JM4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC38.86■■■■□ 3.81
LRRIQ1Q96JM4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC38.86■■■■□ 3.81
LRRIQ1Q96JM4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
LRRIQ1Q96JM4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.86■■■■□ 3.81
LRRIQ1Q96JM4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC38.86■■■■□ 3.81
LRRIQ1Q96JM4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC38.85■■■■□ 3.81
LRRIQ1Q96JM4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
LRRIQ1Q96JM4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
LRRIQ1Q96JM4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC38.84■■■■□ 3.81
LRRIQ1Q96JM4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
LRRIQ1Q96JM4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
LRRIQ1Q96JM4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC38.83■■■■□ 3.81
LRRIQ1Q96JM4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.83■■■■□ 3.81
LRRIQ1Q96JM4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
LRRIQ1Q96JM4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC38.82■■■■□ 3.81
LRRIQ1Q96JM4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC38.82■■■■□ 3.81
LRRIQ1Q96JM4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
LRRIQ1Q96JM4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
LRRIQ1Q96JM4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
LRRIQ1Q96JM4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC38.8■■■■□ 3.8
LRRIQ1Q96JM4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
LRRIQ1Q96JM4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC38.8■■■■□ 3.8
LRRIQ1Q96JM4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC38.8■■■■□ 3.8
LRRIQ1Q96JM4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
LRRIQ1Q96JM4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC38.79■■■■□ 3.8
LRRIQ1Q96JM4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC38.79■■■■□ 3.8
LRRIQ1Q96JM4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
LRRIQ1Q96JM4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
LRRIQ1Q96JM4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.79■■■■□ 3.8
LRRIQ1Q96JM4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
LRRIQ1Q96JM4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC38.78■■■■□ 3.8
LRRIQ1Q96JM4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC38.78■■■■□ 3.8
LRRIQ1Q96JM4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC38.77■■■■□ 3.8
LRRIQ1Q96JM4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
LRRIQ1Q96JM4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC38.76■■■■□ 3.8
LRRIQ1Q96JM4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.76■■■■□ 3.8
LRRIQ1Q96JM4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.76■■■■□ 3.8
LRRIQ1Q96JM4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.79
LRRIQ1Q96JM4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.79
LRRIQ1Q96JM4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.76■■■■□ 3.79
LRRIQ1Q96JM4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC38.75■■■■□ 3.79
LRRIQ1Q96JM4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC38.75■■■■□ 3.79
LRRIQ1Q96JM4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.74■■■■□ 3.79
LRRIQ1Q96JM4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC38.74■■■■□ 3.79
LRRIQ1Q96JM4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
LRRIQ1Q96JM4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
LRRIQ1Q96JM4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
LRRIQ1Q96JM4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC38.73■■■■□ 3.79
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