Protein–RNA interactions for Protein: Q96G28

CFAP36, Cilia- and flagella-associated protein 36, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP36Q96G28 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CFAP36Q96G28 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CFAP36Q96G28 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CFAP36Q96G28 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFAP36Q96G28 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFAP36Q96G28 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFAP36Q96G28 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CFAP36Q96G28 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP36Q96G28 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP36Q96G28 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP36Q96G28 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP36Q96G28 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CFAP36Q96G28 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CFAP36Q96G28 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CFAP36Q96G28 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CFAP36Q96G28 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CFAP36Q96G28 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CFAP36Q96G28 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CFAP36Q96G28 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CFAP36Q96G28 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CFAP36Q96G28 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CFAP36Q96G28 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CFAP36Q96G28 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CFAP36Q96G28 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CFAP36Q96G28 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CFAP36Q96G28 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CFAP36Q96G28 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CFAP36Q96G28 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CFAP36Q96G28 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CFAP36Q96G28 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CFAP36Q96G28 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CFAP36Q96G28 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CFAP36Q96G28 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CFAP36Q96G28 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CFAP36Q96G28 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CFAP36Q96G28 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CFAP36Q96G28 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CFAP36Q96G28 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CFAP36Q96G28 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CFAP36Q96G28 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CFAP36Q96G28 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CFAP36Q96G28 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CFAP36Q96G28 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CFAP36Q96G28 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CFAP36Q96G28 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CFAP36Q96G28 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CFAP36Q96G28 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CFAP36Q96G28 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CFAP36Q96G28 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CFAP36Q96G28 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CFAP36Q96G28 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CFAP36Q96G28 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CFAP36Q96G28 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CFAP36Q96G28 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CFAP36Q96G28 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CFAP36Q96G28 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CFAP36Q96G28 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CFAP36Q96G28 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CFAP36Q96G28 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CFAP36Q96G28 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CFAP36Q96G28 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CFAP36Q96G28 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CFAP36Q96G28 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CFAP36Q96G28 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CFAP36Q96G28 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CFAP36Q96G28 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CFAP36Q96G28 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CFAP36Q96G28 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFAP36Q96G28 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFAP36Q96G28 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFAP36Q96G28 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CFAP36Q96G28 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFAP36Q96G28 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFAP36Q96G28 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFAP36Q96G28 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFAP36Q96G28 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFAP36Q96G28 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFAP36Q96G28 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFAP36Q96G28 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFAP36Q96G28 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFAP36Q96G28 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFAP36Q96G28 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFAP36Q96G28 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFAP36Q96G28 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFAP36Q96G28 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFAP36Q96G28 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFAP36Q96G28 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFAP36Q96G28 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFAP36Q96G28 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFAP36Q96G28 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFAP36Q96G28 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFAP36Q96G28 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFAP36Q96G28 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CFAP36Q96G28 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CFAP36Q96G28 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CFAP36Q96G28 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFAP36Q96G28 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFAP36Q96G28 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFAP36Q96G28 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFAP36Q96G28 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms