Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH8

NEURL3, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL3, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL3Q96EH8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEURL3Q96EH8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEURL3Q96EH8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEURL3Q96EH8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEURL3Q96EH8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEURL3Q96EH8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEURL3Q96EH8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NEURL3Q96EH8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEURL3Q96EH8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEURL3Q96EH8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEURL3Q96EH8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEURL3Q96EH8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEURL3Q96EH8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEURL3Q96EH8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEURL3Q96EH8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEURL3Q96EH8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEURL3Q96EH8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEURL3Q96EH8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEURL3Q96EH8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEURL3Q96EH8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NEURL3Q96EH8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEURL3Q96EH8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEURL3Q96EH8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEURL3Q96EH8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEURL3Q96EH8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEURL3Q96EH8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEURL3Q96EH8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEURL3Q96EH8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEURL3Q96EH8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEURL3Q96EH8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEURL3Q96EH8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEURL3Q96EH8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEURL3Q96EH8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEURL3Q96EH8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEURL3Q96EH8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NEURL3Q96EH8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEURL3Q96EH8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEURL3Q96EH8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEURL3Q96EH8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NEURL3Q96EH8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEURL3Q96EH8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEURL3Q96EH8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEURL3Q96EH8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NEURL3Q96EH8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEURL3Q96EH8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEURL3Q96EH8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NEURL3Q96EH8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEURL3Q96EH8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEURL3Q96EH8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NEURL3Q96EH8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEURL3Q96EH8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEURL3Q96EH8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEURL3Q96EH8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEURL3Q96EH8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEURL3Q96EH8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEURL3Q96EH8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEURL3Q96EH8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEURL3Q96EH8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEURL3Q96EH8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEURL3Q96EH8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEURL3Q96EH8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEURL3Q96EH8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEURL3Q96EH8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEURL3Q96EH8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEURL3Q96EH8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEURL3Q96EH8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEURL3Q96EH8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEURL3Q96EH8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEURL3Q96EH8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEURL3Q96EH8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEURL3Q96EH8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEURL3Q96EH8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEURL3Q96EH8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEURL3Q96EH8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEURL3Q96EH8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEURL3Q96EH8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEURL3Q96EH8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEURL3Q96EH8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEURL3Q96EH8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEURL3Q96EH8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEURL3Q96EH8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEURL3Q96EH8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEURL3Q96EH8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEURL3Q96EH8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEURL3Q96EH8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEURL3Q96EH8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NEURL3Q96EH8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NEURL3Q96EH8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NEURL3Q96EH8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NEURL3Q96EH8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
NEURL3Q96EH8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NEURL3Q96EH8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NEURL3Q96EH8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NEURL3Q96EH8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NEURL3Q96EH8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NEURL3Q96EH8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NEURL3Q96EH8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEURL3Q96EH8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEURL3Q96EH8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEURL3Q96EH8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms