Protein–RNA interactions for Protein: Q96E17

RAB3C, Ras-related protein Rab-3C, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3CQ96E17 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB3CQ96E17 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB3CQ96E17 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB3CQ96E17 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB3CQ96E17 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB3CQ96E17 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB3CQ96E17 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB3CQ96E17 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB3CQ96E17 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB3CQ96E17 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB3CQ96E17 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB3CQ96E17 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB3CQ96E17 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB3CQ96E17 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB3CQ96E17 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB3CQ96E17 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB3CQ96E17 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB3CQ96E17 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB3CQ96E17 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB3CQ96E17 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB3CQ96E17 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB3CQ96E17 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB3CQ96E17 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB3CQ96E17 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB3CQ96E17 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB3CQ96E17 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB3CQ96E17 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB3CQ96E17 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB3CQ96E17 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB3CQ96E17 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB3CQ96E17 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB3CQ96E17 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB3CQ96E17 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB3CQ96E17 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB3CQ96E17 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB3CQ96E17 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB3CQ96E17 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB3CQ96E17 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB3CQ96E17 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB3CQ96E17 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB3CQ96E17 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB3CQ96E17 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB3CQ96E17 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB3CQ96E17 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB3CQ96E17 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB3CQ96E17 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAB3CQ96E17 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAB3CQ96E17 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAB3CQ96E17 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAB3CQ96E17 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAB3CQ96E17 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAB3CQ96E17 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB3CQ96E17 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB3CQ96E17 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB3CQ96E17 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB3CQ96E17 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB3CQ96E17 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB3CQ96E17 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB3CQ96E17 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
RAB3CQ96E17 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAB3CQ96E17 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAB3CQ96E17 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAB3CQ96E17 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAB3CQ96E17 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAB3CQ96E17 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB3CQ96E17 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB3CQ96E17 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB3CQ96E17 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB3CQ96E17 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB3CQ96E17 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB3CQ96E17 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB3CQ96E17 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB3CQ96E17 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB3CQ96E17 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB3CQ96E17 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB3CQ96E17 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB3CQ96E17 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB3CQ96E17 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB3CQ96E17 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB3CQ96E17 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB3CQ96E17 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB3CQ96E17 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB3CQ96E17 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB3CQ96E17 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB3CQ96E17 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB3CQ96E17 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB3CQ96E17 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB3CQ96E17 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB3CQ96E17 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB3CQ96E17 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB3CQ96E17 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB3CQ96E17 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB3CQ96E17 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB3CQ96E17 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB3CQ96E17 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB3CQ96E17 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB3CQ96E17 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB3CQ96E17 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB3CQ96E17 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB3CQ96E17 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms