Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC9

OTUB2, Ubiquitin thioesterase OTUB2, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB2Q96DC9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
OTUB2Q96DC9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
OTUB2Q96DC9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
OTUB2Q96DC9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
OTUB2Q96DC9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
OTUB2Q96DC9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
OTUB2Q96DC9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
OTUB2Q96DC9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
OTUB2Q96DC9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
OTUB2Q96DC9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
OTUB2Q96DC9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
OTUB2Q96DC9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
OTUB2Q96DC9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
OTUB2Q96DC9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
OTUB2Q96DC9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
OTUB2Q96DC9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
OTUB2Q96DC9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
OTUB2Q96DC9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
OTUB2Q96DC9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
OTUB2Q96DC9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
OTUB2Q96DC9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
OTUB2Q96DC9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
OTUB2Q96DC9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
OTUB2Q96DC9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
OTUB2Q96DC9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
OTUB2Q96DC9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
OTUB2Q96DC9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
OTUB2Q96DC9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
OTUB2Q96DC9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
OTUB2Q96DC9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
OTUB2Q96DC9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
OTUB2Q96DC9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
OTUB2Q96DC9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
OTUB2Q96DC9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
OTUB2Q96DC9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
OTUB2Q96DC9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
OTUB2Q96DC9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
OTUB2Q96DC9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
OTUB2Q96DC9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
OTUB2Q96DC9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
OTUB2Q96DC9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
OTUB2Q96DC9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
OTUB2Q96DC9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
OTUB2Q96DC9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
OTUB2Q96DC9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
OTUB2Q96DC9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
OTUB2Q96DC9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
OTUB2Q96DC9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
OTUB2Q96DC9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
OTUB2Q96DC9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
OTUB2Q96DC9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
OTUB2Q96DC9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
OTUB2Q96DC9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
OTUB2Q96DC9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
OTUB2Q96DC9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
OTUB2Q96DC9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
OTUB2Q96DC9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
OTUB2Q96DC9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
OTUB2Q96DC9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
OTUB2Q96DC9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
OTUB2Q96DC9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
OTUB2Q96DC9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
OTUB2Q96DC9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
OTUB2Q96DC9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
OTUB2Q96DC9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
OTUB2Q96DC9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
OTUB2Q96DC9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
OTUB2Q96DC9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
OTUB2Q96DC9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
OTUB2Q96DC9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
OTUB2Q96DC9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
OTUB2Q96DC9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
OTUB2Q96DC9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
OTUB2Q96DC9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
OTUB2Q96DC9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
OTUB2Q96DC9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
OTUB2Q96DC9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
OTUB2Q96DC9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
OTUB2Q96DC9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
OTUB2Q96DC9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
OTUB2Q96DC9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
OTUB2Q96DC9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
OTUB2Q96DC9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
OTUB2Q96DC9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
OTUB2Q96DC9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
OTUB2Q96DC9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
OTUB2Q96DC9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
OTUB2Q96DC9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
OTUB2Q96DC9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
OTUB2Q96DC9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
OTUB2Q96DC9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
OTUB2Q96DC9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
OTUB2Q96DC9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
OTUB2Q96DC9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
OTUB2Q96DC9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
OTUB2Q96DC9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
OTUB2Q96DC9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
OTUB2Q96DC9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
OTUB2Q96DC9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
OTUB2Q96DC9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.9 ms