Protein–RNA interactions for Protein: Q96B33

CLDN23, Claudin-23, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN23Q96B33 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLDN23Q96B33 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLDN23Q96B33 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLDN23Q96B33 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLDN23Q96B33 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLDN23Q96B33 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLDN23Q96B33 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLDN23Q96B33 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLDN23Q96B33 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLDN23Q96B33 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLDN23Q96B33 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLDN23Q96B33 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLDN23Q96B33 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLDN23Q96B33 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLDN23Q96B33 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLDN23Q96B33 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLDN23Q96B33 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLDN23Q96B33 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLDN23Q96B33 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLDN23Q96B33 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLDN23Q96B33 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLDN23Q96B33 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLDN23Q96B33 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLDN23Q96B33 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLDN23Q96B33 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLDN23Q96B33 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLDN23Q96B33 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLDN23Q96B33 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLDN23Q96B33 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLDN23Q96B33 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLDN23Q96B33 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLDN23Q96B33 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLDN23Q96B33 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLDN23Q96B33 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLDN23Q96B33 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLDN23Q96B33 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLDN23Q96B33 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLDN23Q96B33 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLDN23Q96B33 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CLDN23Q96B33 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLDN23Q96B33 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CLDN23Q96B33 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CLDN23Q96B33 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLDN23Q96B33 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLDN23Q96B33 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLDN23Q96B33 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLDN23Q96B33 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLDN23Q96B33 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLDN23Q96B33 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLDN23Q96B33 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLDN23Q96B33 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLDN23Q96B33 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLDN23Q96B33 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLDN23Q96B33 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CLDN23Q96B33 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLDN23Q96B33 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLDN23Q96B33 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CLDN23Q96B33 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLDN23Q96B33 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLDN23Q96B33 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLDN23Q96B33 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLDN23Q96B33 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLDN23Q96B33 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLDN23Q96B33 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLDN23Q96B33 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLDN23Q96B33 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLDN23Q96B33 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLDN23Q96B33 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLDN23Q96B33 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLDN23Q96B33 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLDN23Q96B33 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLDN23Q96B33 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLDN23Q96B33 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLDN23Q96B33 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CLDN23Q96B33 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CLDN23Q96B33 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CLDN23Q96B33 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLDN23Q96B33 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLDN23Q96B33 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLDN23Q96B33 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLDN23Q96B33 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLDN23Q96B33 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLDN23Q96B33 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLDN23Q96B33 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLDN23Q96B33 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLDN23Q96B33 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLDN23Q96B33 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLDN23Q96B33 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CLDN23Q96B33 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLDN23Q96B33 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLDN23Q96B33 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLDN23Q96B33 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLDN23Q96B33 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLDN23Q96B33 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLDN23Q96B33 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLDN23Q96B33 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLDN23Q96B33 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLDN23Q96B33 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLDN23Q96B33 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLDN23Q96B33 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms