Protein–RNA interactions for Protein: Q96A05

ATP6V1E2, V-type proton ATPase subunit E 2, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E2Q96A05 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ATP6V1E2Q96A05 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP6V1E2Q96A05 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP6V1E2Q96A05 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP6V1E2Q96A05 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP6V1E2Q96A05 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP6V1E2Q96A05 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP6V1E2Q96A05 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP6V1E2Q96A05 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP6V1E2Q96A05 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP6V1E2Q96A05 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP6V1E2Q96A05 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP6V1E2Q96A05 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP6V1E2Q96A05 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP6V1E2Q96A05 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP6V1E2Q96A05 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP6V1E2Q96A05 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP6V1E2Q96A05 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP6V1E2Q96A05 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP6V1E2Q96A05 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP6V1E2Q96A05 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP6V1E2Q96A05 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP6V1E2Q96A05 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP6V1E2Q96A05 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP6V1E2Q96A05 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP6V1E2Q96A05 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP6V1E2Q96A05 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP6V1E2Q96A05 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP6V1E2Q96A05 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP6V1E2Q96A05 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP6V1E2Q96A05 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATP6V1E2Q96A05 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP6V1E2Q96A05 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP6V1E2Q96A05 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP6V1E2Q96A05 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP6V1E2Q96A05 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP6V1E2Q96A05 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP6V1E2Q96A05 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP6V1E2Q96A05 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP6V1E2Q96A05 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP6V1E2Q96A05 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP6V1E2Q96A05 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP6V1E2Q96A05 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP6V1E2Q96A05 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP6V1E2Q96A05 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP6V1E2Q96A05 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP6V1E2Q96A05 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP6V1E2Q96A05 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP6V1E2Q96A05 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP6V1E2Q96A05 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP6V1E2Q96A05 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP6V1E2Q96A05 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP6V1E2Q96A05 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP6V1E2Q96A05 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP6V1E2Q96A05 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP6V1E2Q96A05 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP6V1E2Q96A05 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP6V1E2Q96A05 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP6V1E2Q96A05 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP6V1E2Q96A05 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP6V1E2Q96A05 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP6V1E2Q96A05 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP6V1E2Q96A05 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP6V1E2Q96A05 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP6V1E2Q96A05 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP6V1E2Q96A05 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP6V1E2Q96A05 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP6V1E2Q96A05 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP6V1E2Q96A05 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP6V1E2Q96A05 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP6V1E2Q96A05 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP6V1E2Q96A05 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP6V1E2Q96A05 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP6V1E2Q96A05 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP6V1E2Q96A05 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP6V1E2Q96A05 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP6V1E2Q96A05 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP6V1E2Q96A05 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP6V1E2Q96A05 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP6V1E2Q96A05 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP6V1E2Q96A05 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP6V1E2Q96A05 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP6V1E2Q96A05 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP6V1E2Q96A05 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP6V1E2Q96A05 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP6V1E2Q96A05 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP6V1E2Q96A05 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP6V1E2Q96A05 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP6V1E2Q96A05 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP6V1E2Q96A05 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP6V1E2Q96A05 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP6V1E2Q96A05 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP6V1E2Q96A05 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP6V1E2Q96A05 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP6V1E2Q96A05 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP6V1E2Q96A05 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP6V1E2Q96A05 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP6V1E2Q96A05 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP6V1E2Q96A05 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP6V1E2Q96A05 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms