Protein–RNA interactions for Protein: Q92935

EXTL1, Exostosin-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL1Q92935 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EXTL1Q92935 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EXTL1Q92935 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
EXTL1Q92935 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EXTL1Q92935 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EXTL1Q92935 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EXTL1Q92935 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EXTL1Q92935 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EXTL1Q92935 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EXTL1Q92935 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EXTL1Q92935 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EXTL1Q92935 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXTL1Q92935 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXTL1Q92935 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXTL1Q92935 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXTL1Q92935 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXTL1Q92935 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXTL1Q92935 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXTL1Q92935 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXTL1Q92935 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXTL1Q92935 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EXTL1Q92935 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EXTL1Q92935 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EXTL1Q92935 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EXTL1Q92935 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EXTL1Q92935 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EXTL1Q92935 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EXTL1Q92935 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EXTL1Q92935 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EXTL1Q92935 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EXTL1Q92935 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EXTL1Q92935 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
EXTL1Q92935 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EXTL1Q92935 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EXTL1Q92935 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EXTL1Q92935 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EXTL1Q92935 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EXTL1Q92935 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EXTL1Q92935 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EXTL1Q92935 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EXTL1Q92935 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EXTL1Q92935 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EXTL1Q92935 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EXTL1Q92935 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EXTL1Q92935 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EXTL1Q92935 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EXTL1Q92935 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EXTL1Q92935 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EXTL1Q92935 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EXTL1Q92935 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EXTL1Q92935 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
EXTL1Q92935 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EXTL1Q92935 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
EXTL1Q92935 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EXTL1Q92935 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
EXTL1Q92935 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXTL1Q92935 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXTL1Q92935 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXTL1Q92935 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXTL1Q92935 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
EXTL1Q92935 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXTL1Q92935 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXTL1Q92935 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXTL1Q92935 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EXTL1Q92935 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EXTL1Q92935 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EXTL1Q92935 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EXTL1Q92935 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EXTL1Q92935 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EXTL1Q92935 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EXTL1Q92935 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EXTL1Q92935 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EXTL1Q92935 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
EXTL1Q92935 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
EXTL1Q92935 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EXTL1Q92935 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
EXTL1Q92935 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EXTL1Q92935 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EXTL1Q92935 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EXTL1Q92935 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EXTL1Q92935 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EXTL1Q92935 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EXTL1Q92935 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EXTL1Q92935 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EXTL1Q92935 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EXTL1Q92935 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EXTL1Q92935 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EXTL1Q92935 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EXTL1Q92935 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EXTL1Q92935 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EXTL1Q92935 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EXTL1Q92935 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EXTL1Q92935 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EXTL1Q92935 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EXTL1Q92935 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EXTL1Q92935 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EXTL1Q92935 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EXTL1Q92935 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EXTL1Q92935 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EXTL1Q92935 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms