Protein–RNA interactions for Protein: Q92890

UFD1, Ubiquitin recognition factor in ER-associated degradation protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFD1Q92890 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UFD1Q92890 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UFD1Q92890 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UFD1Q92890 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UFD1Q92890 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UFD1Q92890 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UFD1Q92890 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UFD1Q92890 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UFD1Q92890 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UFD1Q92890 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UFD1Q92890 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UFD1Q92890 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
UFD1Q92890 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UFD1Q92890 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UFD1Q92890 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UFD1Q92890 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UFD1Q92890 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UFD1Q92890 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UFD1Q92890 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UFD1Q92890 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UFD1Q92890 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UFD1Q92890 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
UFD1Q92890 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UFD1Q92890 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UFD1Q92890 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UFD1Q92890 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UFD1Q92890 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UFD1Q92890 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UFD1Q92890 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
UFD1Q92890 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UFD1Q92890 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UFD1Q92890 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UFD1Q92890 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UFD1Q92890 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UFD1Q92890 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UFD1Q92890 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UFD1Q92890 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UFD1Q92890 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UFD1Q92890 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UFD1Q92890 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UFD1Q92890 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UFD1Q92890 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UFD1Q92890 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UFD1Q92890 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UFD1Q92890 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UFD1Q92890 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UFD1Q92890 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UFD1Q92890 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UFD1Q92890 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UFD1Q92890 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UFD1Q92890 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UFD1Q92890 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UFD1Q92890 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UFD1Q92890 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UFD1Q92890 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
UFD1Q92890 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UFD1Q92890 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UFD1Q92890 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UFD1Q92890 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UFD1Q92890 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UFD1Q92890 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UFD1Q92890 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UFD1Q92890 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UFD1Q92890 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
UFD1Q92890 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
UFD1Q92890 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UFD1Q92890 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UFD1Q92890 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UFD1Q92890 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UFD1Q92890 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UFD1Q92890 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
UFD1Q92890 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UFD1Q92890 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UFD1Q92890 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UFD1Q92890 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UFD1Q92890 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UFD1Q92890 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UFD1Q92890 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UFD1Q92890 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UFD1Q92890 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UFD1Q92890 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UFD1Q92890 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UFD1Q92890 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UFD1Q92890 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UFD1Q92890 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
UFD1Q92890 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UFD1Q92890 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UFD1Q92890 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UFD1Q92890 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UFD1Q92890 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UFD1Q92890 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UFD1Q92890 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UFD1Q92890 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UFD1Q92890 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UFD1Q92890 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UFD1Q92890 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UFD1Q92890 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UFD1Q92890 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UFD1Q92890 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UFD1Q92890 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms