Protein–RNA interactions for Protein: Q92764

KRT35, Keratin, type I cuticular Ha5, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT35Q92764 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KRT35Q92764 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
KRT35Q92764 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT35Q92764 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT35Q92764 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT35Q92764 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT35Q92764 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT35Q92764 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT35Q92764 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT35Q92764 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT35Q92764 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT35Q92764 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT35Q92764 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT35Q92764 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT35Q92764 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT35Q92764 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT35Q92764 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT35Q92764 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT35Q92764 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT35Q92764 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT35Q92764 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT35Q92764 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT35Q92764 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT35Q92764 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT35Q92764 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT35Q92764 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT35Q92764 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT35Q92764 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT35Q92764 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KRT35Q92764 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KRT35Q92764 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KRT35Q92764 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT35Q92764 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT35Q92764 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT35Q92764 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT35Q92764 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT35Q92764 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT35Q92764 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT35Q92764 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT35Q92764 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT35Q92764 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT35Q92764 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT35Q92764 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT35Q92764 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT35Q92764 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT35Q92764 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT35Q92764 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT35Q92764 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT35Q92764 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT35Q92764 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT35Q92764 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT35Q92764 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT35Q92764 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT35Q92764 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT35Q92764 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT35Q92764 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT35Q92764 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT35Q92764 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT35Q92764 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT35Q92764 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT35Q92764 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT35Q92764 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT35Q92764 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT35Q92764 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT35Q92764 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT35Q92764 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT35Q92764 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT35Q92764 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT35Q92764 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT35Q92764 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT35Q92764 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT35Q92764 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT35Q92764 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT35Q92764 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT35Q92764 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT35Q92764 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT35Q92764 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT35Q92764 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT35Q92764 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT35Q92764 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT35Q92764 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT35Q92764 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT35Q92764 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT35Q92764 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT35Q92764 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT35Q92764 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT35Q92764 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT35Q92764 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT35Q92764 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT35Q92764 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT35Q92764 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT35Q92764 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT35Q92764 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT35Q92764 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT35Q92764 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT35Q92764 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT35Q92764 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT35Q92764 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT35Q92764 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT35Q92764 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms