Protein–RNA interactions for Protein: Q92753

RORB, Nuclear receptor ROR-beta, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORBQ92753 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RORBQ92753 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RORBQ92753 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RORBQ92753 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RORBQ92753 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RORBQ92753 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RORBQ92753 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RORBQ92753 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RORBQ92753 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RORBQ92753 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RORBQ92753 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RORBQ92753 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RORBQ92753 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RORBQ92753 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RORBQ92753 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RORBQ92753 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RORBQ92753 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RORBQ92753 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RORBQ92753 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RORBQ92753 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RORBQ92753 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RORBQ92753 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RORBQ92753 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RORBQ92753 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RORBQ92753 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RORBQ92753 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RORBQ92753 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RORBQ92753 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RORBQ92753 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RORBQ92753 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RORBQ92753 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RORBQ92753 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RORBQ92753 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RORBQ92753 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RORBQ92753 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RORBQ92753 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RORBQ92753 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RORBQ92753 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RORBQ92753 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RORBQ92753 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RORBQ92753 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RORBQ92753 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RORBQ92753 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RORBQ92753 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RORBQ92753 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RORBQ92753 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RORBQ92753 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RORBQ92753 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RORBQ92753 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RORBQ92753 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RORBQ92753 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RORBQ92753 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RORBQ92753 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RORBQ92753 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RORBQ92753 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RORBQ92753 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RORBQ92753 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RORBQ92753 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RORBQ92753 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RORBQ92753 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RORBQ92753 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RORBQ92753 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RORBQ92753 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RORBQ92753 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RORBQ92753 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RORBQ92753 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RORBQ92753 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RORBQ92753 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RORBQ92753 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RORBQ92753 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RORBQ92753 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RORBQ92753 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RORBQ92753 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RORBQ92753 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RORBQ92753 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RORBQ92753 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RORBQ92753 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RORBQ92753 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RORBQ92753 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RORBQ92753 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RORBQ92753 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RORBQ92753 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RORBQ92753 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RORBQ92753 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RORBQ92753 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RORBQ92753 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RORBQ92753 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RORBQ92753 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RORBQ92753 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RORBQ92753 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RORBQ92753 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RORBQ92753 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RORBQ92753 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RORBQ92753 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RORBQ92753 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RORBQ92753 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RORBQ92753 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RORBQ92753 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RORBQ92753 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RORBQ92753 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms