Protein–RNA interactions for Protein: Q92743

HTRA1, Serine protease HTRA1, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA1Q92743 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HTRA1Q92743 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HTRA1Q92743 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HTRA1Q92743 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HTRA1Q92743 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HTRA1Q92743 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HTRA1Q92743 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HTRA1Q92743 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HTRA1Q92743 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HTRA1Q92743 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HTRA1Q92743 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HTRA1Q92743 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HTRA1Q92743 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HTRA1Q92743 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HTRA1Q92743 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HTRA1Q92743 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HTRA1Q92743 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HTRA1Q92743 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HTRA1Q92743 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HTRA1Q92743 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HTRA1Q92743 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HTRA1Q92743 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HTRA1Q92743 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HTRA1Q92743 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HTRA1Q92743 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HTRA1Q92743 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HTRA1Q92743 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HTRA1Q92743 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HTRA1Q92743 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HTRA1Q92743 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HTRA1Q92743 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
HTRA1Q92743 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
HTRA1Q92743 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HTRA1Q92743 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HTRA1Q92743 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HTRA1Q92743 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HTRA1Q92743 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HTRA1Q92743 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HTRA1Q92743 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HTRA1Q92743 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HTRA1Q92743 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HTRA1Q92743 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HTRA1Q92743 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HTRA1Q92743 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HTRA1Q92743 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HTRA1Q92743 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HTRA1Q92743 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HTRA1Q92743 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HTRA1Q92743 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HTRA1Q92743 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HTRA1Q92743 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HTRA1Q92743 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HTRA1Q92743 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HTRA1Q92743 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HTRA1Q92743 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HTRA1Q92743 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HTRA1Q92743 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HTRA1Q92743 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HTRA1Q92743 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HTRA1Q92743 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HTRA1Q92743 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HTRA1Q92743 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HTRA1Q92743 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HTRA1Q92743 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HTRA1Q92743 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HTRA1Q92743 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HTRA1Q92743 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HTRA1Q92743 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HTRA1Q92743 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HTRA1Q92743 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HTRA1Q92743 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HTRA1Q92743 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HTRA1Q92743 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HTRA1Q92743 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HTRA1Q92743 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HTRA1Q92743 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HTRA1Q92743 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HTRA1Q92743 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HTRA1Q92743 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HTRA1Q92743 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HTRA1Q92743 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HTRA1Q92743 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HTRA1Q92743 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HTRA1Q92743 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HTRA1Q92743 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HTRA1Q92743 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HTRA1Q92743 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HTRA1Q92743 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HTRA1Q92743 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HTRA1Q92743 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HTRA1Q92743 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HTRA1Q92743 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HTRA1Q92743 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HTRA1Q92743 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HTRA1Q92743 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HTRA1Q92743 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HTRA1Q92743 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HTRA1Q92743 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HTRA1Q92743 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HTRA1Q92743 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms