Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ04

LRTOMT, Transmembrane O-methyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRTOMTQ8WZ04 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRTOMTQ8WZ04 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRTOMTQ8WZ04 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRTOMTQ8WZ04 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRTOMTQ8WZ04 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRTOMTQ8WZ04 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRTOMTQ8WZ04 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRTOMTQ8WZ04 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRTOMTQ8WZ04 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRTOMTQ8WZ04 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRTOMTQ8WZ04 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRTOMTQ8WZ04 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRTOMTQ8WZ04 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRTOMTQ8WZ04 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRTOMTQ8WZ04 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRTOMTQ8WZ04 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRTOMTQ8WZ04 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LRTOMTQ8WZ04 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LRTOMTQ8WZ04 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRTOMTQ8WZ04 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRTOMTQ8WZ04 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRTOMTQ8WZ04 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRTOMTQ8WZ04 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LRTOMTQ8WZ04 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRTOMTQ8WZ04 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRTOMTQ8WZ04 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRTOMTQ8WZ04 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRTOMTQ8WZ04 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRTOMTQ8WZ04 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRTOMTQ8WZ04 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRTOMTQ8WZ04 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRTOMTQ8WZ04 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRTOMTQ8WZ04 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRTOMTQ8WZ04 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRTOMTQ8WZ04 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRTOMTQ8WZ04 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRTOMTQ8WZ04 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRTOMTQ8WZ04 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRTOMTQ8WZ04 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRTOMTQ8WZ04 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRTOMTQ8WZ04 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRTOMTQ8WZ04 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRTOMTQ8WZ04 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRTOMTQ8WZ04 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRTOMTQ8WZ04 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRTOMTQ8WZ04 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRTOMTQ8WZ04 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRTOMTQ8WZ04 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRTOMTQ8WZ04 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRTOMTQ8WZ04 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRTOMTQ8WZ04 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
LRTOMTQ8WZ04 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRTOMTQ8WZ04 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRTOMTQ8WZ04 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LRTOMTQ8WZ04 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRTOMTQ8WZ04 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRTOMTQ8WZ04 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRTOMTQ8WZ04 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRTOMTQ8WZ04 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRTOMTQ8WZ04 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRTOMTQ8WZ04 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LRTOMTQ8WZ04 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRTOMTQ8WZ04 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRTOMTQ8WZ04 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRTOMTQ8WZ04 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRTOMTQ8WZ04 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRTOMTQ8WZ04 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRTOMTQ8WZ04 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRTOMTQ8WZ04 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LRTOMTQ8WZ04 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRTOMTQ8WZ04 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRTOMTQ8WZ04 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LRTOMTQ8WZ04 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRTOMTQ8WZ04 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRTOMTQ8WZ04 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRTOMTQ8WZ04 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRTOMTQ8WZ04 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRTOMTQ8WZ04 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRTOMTQ8WZ04 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRTOMTQ8WZ04 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRTOMTQ8WZ04 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRTOMTQ8WZ04 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRTOMTQ8WZ04 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRTOMTQ8WZ04 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRTOMTQ8WZ04 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRTOMTQ8WZ04 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRTOMTQ8WZ04 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
LRTOMTQ8WZ04 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRTOMTQ8WZ04 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRTOMTQ8WZ04 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRTOMTQ8WZ04 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRTOMTQ8WZ04 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRTOMTQ8WZ04 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRTOMTQ8WZ04 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRTOMTQ8WZ04 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRTOMTQ8WZ04 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRTOMTQ8WZ04 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRTOMTQ8WZ04 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRTOMTQ8WZ04 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRTOMTQ8WZ04 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms