Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF1

C1orf54, Uncharacterized protein C1orf54, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf54Q8WWF1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
C1orf54Q8WWF1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
C1orf54Q8WWF1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
C1orf54Q8WWF1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
C1orf54Q8WWF1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
C1orf54Q8WWF1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
C1orf54Q8WWF1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
C1orf54Q8WWF1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
C1orf54Q8WWF1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
C1orf54Q8WWF1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
C1orf54Q8WWF1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
C1orf54Q8WWF1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
C1orf54Q8WWF1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
C1orf54Q8WWF1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
C1orf54Q8WWF1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
C1orf54Q8WWF1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
C1orf54Q8WWF1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
C1orf54Q8WWF1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
C1orf54Q8WWF1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
C1orf54Q8WWF1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
C1orf54Q8WWF1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
C1orf54Q8WWF1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
C1orf54Q8WWF1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
C1orf54Q8WWF1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
C1orf54Q8WWF1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
C1orf54Q8WWF1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
C1orf54Q8WWF1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
C1orf54Q8WWF1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
C1orf54Q8WWF1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
C1orf54Q8WWF1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
C1orf54Q8WWF1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
C1orf54Q8WWF1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
C1orf54Q8WWF1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
C1orf54Q8WWF1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
C1orf54Q8WWF1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
C1orf54Q8WWF1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
C1orf54Q8WWF1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
C1orf54Q8WWF1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
C1orf54Q8WWF1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
C1orf54Q8WWF1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
C1orf54Q8WWF1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
C1orf54Q8WWF1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
C1orf54Q8WWF1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
C1orf54Q8WWF1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
C1orf54Q8WWF1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
C1orf54Q8WWF1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
C1orf54Q8WWF1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
C1orf54Q8WWF1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
C1orf54Q8WWF1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
C1orf54Q8WWF1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
C1orf54Q8WWF1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
C1orf54Q8WWF1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
C1orf54Q8WWF1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
C1orf54Q8WWF1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
C1orf54Q8WWF1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
C1orf54Q8WWF1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
C1orf54Q8WWF1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
C1orf54Q8WWF1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
C1orf54Q8WWF1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
C1orf54Q8WWF1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
C1orf54Q8WWF1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
C1orf54Q8WWF1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
C1orf54Q8WWF1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
C1orf54Q8WWF1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
C1orf54Q8WWF1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
C1orf54Q8WWF1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
C1orf54Q8WWF1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
C1orf54Q8WWF1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
C1orf54Q8WWF1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
C1orf54Q8WWF1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
C1orf54Q8WWF1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C1orf54Q8WWF1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
C1orf54Q8WWF1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
C1orf54Q8WWF1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
C1orf54Q8WWF1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C1orf54Q8WWF1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
C1orf54Q8WWF1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
C1orf54Q8WWF1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
C1orf54Q8WWF1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
C1orf54Q8WWF1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
C1orf54Q8WWF1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
C1orf54Q8WWF1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
C1orf54Q8WWF1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
C1orf54Q8WWF1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
C1orf54Q8WWF1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C1orf54Q8WWF1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C1orf54Q8WWF1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
C1orf54Q8WWF1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C1orf54Q8WWF1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C1orf54Q8WWF1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C1orf54Q8WWF1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
C1orf54Q8WWF1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
C1orf54Q8WWF1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C1orf54Q8WWF1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C1orf54Q8WWF1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C1orf54Q8WWF1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C1orf54Q8WWF1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
C1orf54Q8WWF1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C1orf54Q8WWF1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C1orf54Q8WWF1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms