Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVF5

KCTD4, BTB/POZ domain-containing protein KCTD4, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD4Q8WVF5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCTD4Q8WVF5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCTD4Q8WVF5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCTD4Q8WVF5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCTD4Q8WVF5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCTD4Q8WVF5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCTD4Q8WVF5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCTD4Q8WVF5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCTD4Q8WVF5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCTD4Q8WVF5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCTD4Q8WVF5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KCTD4Q8WVF5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KCTD4Q8WVF5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KCTD4Q8WVF5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
KCTD4Q8WVF5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KCTD4Q8WVF5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCTD4Q8WVF5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCTD4Q8WVF5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCTD4Q8WVF5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCTD4Q8WVF5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCTD4Q8WVF5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCTD4Q8WVF5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCTD4Q8WVF5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCTD4Q8WVF5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCTD4Q8WVF5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCTD4Q8WVF5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCTD4Q8WVF5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCTD4Q8WVF5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCTD4Q8WVF5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCTD4Q8WVF5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCTD4Q8WVF5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCTD4Q8WVF5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCTD4Q8WVF5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCTD4Q8WVF5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCTD4Q8WVF5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCTD4Q8WVF5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCTD4Q8WVF5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
KCTD4Q8WVF5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCTD4Q8WVF5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCTD4Q8WVF5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCTD4Q8WVF5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCTD4Q8WVF5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCTD4Q8WVF5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCTD4Q8WVF5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCTD4Q8WVF5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCTD4Q8WVF5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
KCTD4Q8WVF5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCTD4Q8WVF5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCTD4Q8WVF5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCTD4Q8WVF5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCTD4Q8WVF5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCTD4Q8WVF5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCTD4Q8WVF5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCTD4Q8WVF5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCTD4Q8WVF5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCTD4Q8WVF5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCTD4Q8WVF5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCTD4Q8WVF5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCTD4Q8WVF5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCTD4Q8WVF5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCTD4Q8WVF5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCTD4Q8WVF5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCTD4Q8WVF5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCTD4Q8WVF5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCTD4Q8WVF5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCTD4Q8WVF5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCTD4Q8WVF5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCTD4Q8WVF5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCTD4Q8WVF5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCTD4Q8WVF5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCTD4Q8WVF5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCTD4Q8WVF5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCTD4Q8WVF5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCTD4Q8WVF5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCTD4Q8WVF5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCTD4Q8WVF5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCTD4Q8WVF5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
KCTD4Q8WVF5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
KCTD4Q8WVF5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
KCTD4Q8WVF5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
KCTD4Q8WVF5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
KCTD4Q8WVF5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
KCTD4Q8WVF5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
KCTD4Q8WVF5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
KCTD4Q8WVF5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
KCTD4Q8WVF5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCTD4Q8WVF5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCTD4Q8WVF5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCTD4Q8WVF5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCTD4Q8WVF5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCTD4Q8WVF5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCTD4Q8WVF5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCTD4Q8WVF5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCTD4Q8WVF5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCTD4Q8WVF5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCTD4Q8WVF5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCTD4Q8WVF5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCTD4Q8WVF5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCTD4Q8WVF5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCTD4Q8WVF5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms