Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEE9

SAP25, Histone deacetylase complex subunit SAP25, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAP25Q8TEE9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SAP25Q8TEE9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SAP25Q8TEE9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SAP25Q8TEE9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SAP25Q8TEE9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SAP25Q8TEE9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SAP25Q8TEE9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SAP25Q8TEE9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SAP25Q8TEE9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SAP25Q8TEE9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SAP25Q8TEE9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SAP25Q8TEE9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SAP25Q8TEE9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SAP25Q8TEE9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SAP25Q8TEE9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SAP25Q8TEE9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SAP25Q8TEE9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SAP25Q8TEE9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SAP25Q8TEE9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SAP25Q8TEE9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SAP25Q8TEE9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SAP25Q8TEE9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SAP25Q8TEE9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SAP25Q8TEE9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SAP25Q8TEE9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SAP25Q8TEE9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SAP25Q8TEE9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SAP25Q8TEE9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SAP25Q8TEE9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SAP25Q8TEE9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SAP25Q8TEE9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SAP25Q8TEE9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SAP25Q8TEE9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SAP25Q8TEE9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SAP25Q8TEE9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SAP25Q8TEE9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SAP25Q8TEE9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SAP25Q8TEE9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SAP25Q8TEE9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SAP25Q8TEE9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SAP25Q8TEE9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SAP25Q8TEE9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SAP25Q8TEE9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SAP25Q8TEE9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SAP25Q8TEE9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SAP25Q8TEE9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SAP25Q8TEE9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SAP25Q8TEE9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SAP25Q8TEE9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SAP25Q8TEE9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SAP25Q8TEE9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SAP25Q8TEE9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SAP25Q8TEE9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SAP25Q8TEE9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SAP25Q8TEE9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SAP25Q8TEE9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SAP25Q8TEE9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SAP25Q8TEE9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SAP25Q8TEE9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SAP25Q8TEE9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SAP25Q8TEE9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SAP25Q8TEE9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SAP25Q8TEE9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SAP25Q8TEE9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SAP25Q8TEE9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SAP25Q8TEE9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SAP25Q8TEE9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SAP25Q8TEE9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SAP25Q8TEE9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SAP25Q8TEE9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SAP25Q8TEE9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SAP25Q8TEE9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SAP25Q8TEE9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SAP25Q8TEE9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SAP25Q8TEE9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SAP25Q8TEE9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SAP25Q8TEE9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SAP25Q8TEE9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SAP25Q8TEE9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SAP25Q8TEE9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SAP25Q8TEE9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SAP25Q8TEE9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SAP25Q8TEE9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SAP25Q8TEE9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SAP25Q8TEE9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SAP25Q8TEE9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SAP25Q8TEE9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SAP25Q8TEE9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SAP25Q8TEE9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SAP25Q8TEE9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SAP25Q8TEE9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SAP25Q8TEE9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SAP25Q8TEE9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SAP25Q8TEE9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SAP25Q8TEE9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SAP25Q8TEE9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SAP25Q8TEE9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SAP25Q8TEE9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SAP25Q8TEE9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SAP25Q8TEE9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms