Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFD5

ARID1B, AT-rich interactive domain-containing protein 1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID1BQ8NFD5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARID1BQ8NFD5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARID1BQ8NFD5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARID1BQ8NFD5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARID1BQ8NFD5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARID1BQ8NFD5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARID1BQ8NFD5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARID1BQ8NFD5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARID1BQ8NFD5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARID1BQ8NFD5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARID1BQ8NFD5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARID1BQ8NFD5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ARID1BQ8NFD5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ARID1BQ8NFD5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ARID1BQ8NFD5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ARID1BQ8NFD5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARID1BQ8NFD5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARID1BQ8NFD5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARID1BQ8NFD5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARID1BQ8NFD5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARID1BQ8NFD5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARID1BQ8NFD5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARID1BQ8NFD5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARID1BQ8NFD5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARID1BQ8NFD5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARID1BQ8NFD5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARID1BQ8NFD5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARID1BQ8NFD5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARID1BQ8NFD5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ARID1BQ8NFD5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARID1BQ8NFD5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARID1BQ8NFD5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARID1BQ8NFD5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARID1BQ8NFD5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARID1BQ8NFD5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARID1BQ8NFD5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARID1BQ8NFD5 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARID1BQ8NFD5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARID1BQ8NFD5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARID1BQ8NFD5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ARID1BQ8NFD5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARID1BQ8NFD5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARID1BQ8NFD5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARID1BQ8NFD5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARID1BQ8NFD5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ARID1BQ8NFD5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARID1BQ8NFD5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ARID1BQ8NFD5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ARID1BQ8NFD5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ARID1BQ8NFD5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARID1BQ8NFD5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARID1BQ8NFD5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARID1BQ8NFD5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARID1BQ8NFD5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARID1BQ8NFD5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARID1BQ8NFD5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARID1BQ8NFD5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARID1BQ8NFD5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARID1BQ8NFD5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARID1BQ8NFD5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARID1BQ8NFD5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARID1BQ8NFD5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARID1BQ8NFD5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARID1BQ8NFD5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARID1BQ8NFD5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARID1BQ8NFD5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARID1BQ8NFD5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARID1BQ8NFD5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARID1BQ8NFD5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARID1BQ8NFD5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARID1BQ8NFD5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARID1BQ8NFD5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ARID1BQ8NFD5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARID1BQ8NFD5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARID1BQ8NFD5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARID1BQ8NFD5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARID1BQ8NFD5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARID1BQ8NFD5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARID1BQ8NFD5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARID1BQ8NFD5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ARID1BQ8NFD5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARID1BQ8NFD5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARID1BQ8NFD5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARID1BQ8NFD5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARID1BQ8NFD5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ARID1BQ8NFD5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ARID1BQ8NFD5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARID1BQ8NFD5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARID1BQ8NFD5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARID1BQ8NFD5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ARID1BQ8NFD5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARID1BQ8NFD5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARID1BQ8NFD5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARID1BQ8NFD5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARID1BQ8NFD5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARID1BQ8NFD5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ARID1BQ8NFD5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARID1BQ8NFD5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARID1BQ8NFD5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARID1BQ8NFD5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms