Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEM0

MCPH1, Microcephalin, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCPH1Q8NEM0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MCPH1Q8NEM0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MCPH1Q8NEM0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
MCPH1Q8NEM0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MCPH1Q8NEM0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MCPH1Q8NEM0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MCPH1Q8NEM0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MCPH1Q8NEM0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MCPH1Q8NEM0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MCPH1Q8NEM0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MCPH1Q8NEM0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MCPH1Q8NEM0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MCPH1Q8NEM0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MCPH1Q8NEM0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MCPH1Q8NEM0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MCPH1Q8NEM0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MCPH1Q8NEM0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MCPH1Q8NEM0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MCPH1Q8NEM0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
MCPH1Q8NEM0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MCPH1Q8NEM0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MCPH1Q8NEM0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MCPH1Q8NEM0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MCPH1Q8NEM0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
MCPH1Q8NEM0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
MCPH1Q8NEM0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MCPH1Q8NEM0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MCPH1Q8NEM0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MCPH1Q8NEM0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MCPH1Q8NEM0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MCPH1Q8NEM0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MCPH1Q8NEM0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MCPH1Q8NEM0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MCPH1Q8NEM0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MCPH1Q8NEM0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MCPH1Q8NEM0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MCPH1Q8NEM0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MCPH1Q8NEM0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MCPH1Q8NEM0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MCPH1Q8NEM0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MCPH1Q8NEM0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MCPH1Q8NEM0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MCPH1Q8NEM0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
MCPH1Q8NEM0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MCPH1Q8NEM0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
MCPH1Q8NEM0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MCPH1Q8NEM0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MCPH1Q8NEM0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MCPH1Q8NEM0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MCPH1Q8NEM0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MCPH1Q8NEM0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MCPH1Q8NEM0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
MCPH1Q8NEM0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MCPH1Q8NEM0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MCPH1Q8NEM0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
MCPH1Q8NEM0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MCPH1Q8NEM0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MCPH1Q8NEM0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MCPH1Q8NEM0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MCPH1Q8NEM0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MCPH1Q8NEM0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MCPH1Q8NEM0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MCPH1Q8NEM0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MCPH1Q8NEM0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MCPH1Q8NEM0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MCPH1Q8NEM0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MCPH1Q8NEM0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
MCPH1Q8NEM0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MCPH1Q8NEM0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MCPH1Q8NEM0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MCPH1Q8NEM0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MCPH1Q8NEM0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MCPH1Q8NEM0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MCPH1Q8NEM0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MCPH1Q8NEM0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MCPH1Q8NEM0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MCPH1Q8NEM0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MCPH1Q8NEM0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MCPH1Q8NEM0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MCPH1Q8NEM0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MCPH1Q8NEM0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MCPH1Q8NEM0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MCPH1Q8NEM0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
MCPH1Q8NEM0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MCPH1Q8NEM0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MCPH1Q8NEM0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MCPH1Q8NEM0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MCPH1Q8NEM0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MCPH1Q8NEM0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MCPH1Q8NEM0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MCPH1Q8NEM0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MCPH1Q8NEM0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MCPH1Q8NEM0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
MCPH1Q8NEM0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
MCPH1Q8NEM0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MCPH1Q8NEM0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
MCPH1Q8NEM0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MCPH1Q8NEM0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MCPH1Q8NEM0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
MCPH1Q8NEM0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms