Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE63

HIPK4, Homeodomain-interacting protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIPK4Q8NE63 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HIPK4Q8NE63 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HIPK4Q8NE63 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HIPK4Q8NE63 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HIPK4Q8NE63 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HIPK4Q8NE63 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
HIPK4Q8NE63 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HIPK4Q8NE63 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HIPK4Q8NE63 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HIPK4Q8NE63 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HIPK4Q8NE63 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HIPK4Q8NE63 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HIPK4Q8NE63 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HIPK4Q8NE63 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HIPK4Q8NE63 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HIPK4Q8NE63 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HIPK4Q8NE63 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HIPK4Q8NE63 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HIPK4Q8NE63 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
HIPK4Q8NE63 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HIPK4Q8NE63 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HIPK4Q8NE63 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HIPK4Q8NE63 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
HIPK4Q8NE63 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HIPK4Q8NE63 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HIPK4Q8NE63 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HIPK4Q8NE63 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HIPK4Q8NE63 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
HIPK4Q8NE63 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
HIPK4Q8NE63 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
HIPK4Q8NE63 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HIPK4Q8NE63 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HIPK4Q8NE63 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HIPK4Q8NE63 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HIPK4Q8NE63 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HIPK4Q8NE63 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HIPK4Q8NE63 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HIPK4Q8NE63 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HIPK4Q8NE63 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HIPK4Q8NE63 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HIPK4Q8NE63 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HIPK4Q8NE63 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HIPK4Q8NE63 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HIPK4Q8NE63 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HIPK4Q8NE63 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HIPK4Q8NE63 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HIPK4Q8NE63 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HIPK4Q8NE63 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HIPK4Q8NE63 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HIPK4Q8NE63 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HIPK4Q8NE63 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HIPK4Q8NE63 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HIPK4Q8NE63 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HIPK4Q8NE63 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HIPK4Q8NE63 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HIPK4Q8NE63 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HIPK4Q8NE63 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HIPK4Q8NE63 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HIPK4Q8NE63 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HIPK4Q8NE63 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HIPK4Q8NE63 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HIPK4Q8NE63 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HIPK4Q8NE63 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HIPK4Q8NE63 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HIPK4Q8NE63 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HIPK4Q8NE63 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HIPK4Q8NE63 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HIPK4Q8NE63 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HIPK4Q8NE63 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HIPK4Q8NE63 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HIPK4Q8NE63 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HIPK4Q8NE63 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HIPK4Q8NE63 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HIPK4Q8NE63 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HIPK4Q8NE63 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HIPK4Q8NE63 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HIPK4Q8NE63 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HIPK4Q8NE63 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HIPK4Q8NE63 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HIPK4Q8NE63 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HIPK4Q8NE63 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HIPK4Q8NE63 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HIPK4Q8NE63 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HIPK4Q8NE63 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HIPK4Q8NE63 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HIPK4Q8NE63 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HIPK4Q8NE63 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HIPK4Q8NE63 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HIPK4Q8NE63 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HIPK4Q8NE63 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HIPK4Q8NE63 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HIPK4Q8NE63 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HIPK4Q8NE63 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HIPK4Q8NE63 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HIPK4Q8NE63 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HIPK4Q8NE63 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HIPK4Q8NE63 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HIPK4Q8NE63 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HIPK4Q8NE63 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HIPK4Q8NE63 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms