Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE22

SETD9, SET domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD9Q8NE22 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SETD9Q8NE22 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SETD9Q8NE22 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SETD9Q8NE22 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SETD9Q8NE22 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SETD9Q8NE22 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SETD9Q8NE22 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SETD9Q8NE22 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SETD9Q8NE22 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SETD9Q8NE22 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SETD9Q8NE22 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SETD9Q8NE22 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SETD9Q8NE22 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SETD9Q8NE22 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SETD9Q8NE22 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SETD9Q8NE22 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SETD9Q8NE22 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SETD9Q8NE22 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SETD9Q8NE22 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SETD9Q8NE22 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SETD9Q8NE22 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SETD9Q8NE22 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SETD9Q8NE22 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SETD9Q8NE22 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SETD9Q8NE22 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SETD9Q8NE22 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SETD9Q8NE22 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SETD9Q8NE22 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SETD9Q8NE22 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SETD9Q8NE22 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SETD9Q8NE22 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SETD9Q8NE22 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SETD9Q8NE22 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SETD9Q8NE22 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SETD9Q8NE22 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SETD9Q8NE22 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SETD9Q8NE22 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SETD9Q8NE22 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SETD9Q8NE22 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SETD9Q8NE22 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SETD9Q8NE22 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SETD9Q8NE22 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SETD9Q8NE22 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SETD9Q8NE22 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SETD9Q8NE22 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SETD9Q8NE22 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SETD9Q8NE22 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SETD9Q8NE22 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SETD9Q8NE22 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SETD9Q8NE22 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SETD9Q8NE22 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SETD9Q8NE22 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SETD9Q8NE22 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SETD9Q8NE22 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SETD9Q8NE22 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SETD9Q8NE22 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SETD9Q8NE22 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SETD9Q8NE22 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SETD9Q8NE22 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SETD9Q8NE22 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SETD9Q8NE22 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SETD9Q8NE22 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SETD9Q8NE22 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SETD9Q8NE22 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SETD9Q8NE22 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SETD9Q8NE22 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SETD9Q8NE22 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SETD9Q8NE22 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SETD9Q8NE22 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SETD9Q8NE22 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SETD9Q8NE22 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SETD9Q8NE22 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SETD9Q8NE22 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SETD9Q8NE22 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SETD9Q8NE22 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SETD9Q8NE22 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SETD9Q8NE22 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SETD9Q8NE22 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SETD9Q8NE22 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SETD9Q8NE22 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SETD9Q8NE22 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SETD9Q8NE22 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SETD9Q8NE22 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SETD9Q8NE22 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SETD9Q8NE22 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SETD9Q8NE22 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SETD9Q8NE22 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SETD9Q8NE22 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SETD9Q8NE22 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SETD9Q8NE22 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SETD9Q8NE22 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SETD9Q8NE22 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SETD9Q8NE22 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SETD9Q8NE22 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SETD9Q8NE22 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SETD9Q8NE22 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SETD9Q8NE22 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SETD9Q8NE22 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SETD9Q8NE22 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SETD9Q8NE22 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms