Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCL9

APCDD1L, Protein APCDD1-like, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCDD1LQ8NCL9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APCDD1LQ8NCL9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
APCDD1LQ8NCL9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APCDD1LQ8NCL9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
APCDD1LQ8NCL9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
APCDD1LQ8NCL9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
APCDD1LQ8NCL9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APCDD1LQ8NCL9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APCDD1LQ8NCL9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
APCDD1LQ8NCL9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APCDD1LQ8NCL9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
APCDD1LQ8NCL9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
APCDD1LQ8NCL9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
APCDD1LQ8NCL9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
APCDD1LQ8NCL9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
APCDD1LQ8NCL9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
APCDD1LQ8NCL9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
APCDD1LQ8NCL9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APCDD1LQ8NCL9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
APCDD1LQ8NCL9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APCDD1LQ8NCL9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
APCDD1LQ8NCL9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APCDD1LQ8NCL9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
APCDD1LQ8NCL9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
APCDD1LQ8NCL9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
APCDD1LQ8NCL9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APCDD1LQ8NCL9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
APCDD1LQ8NCL9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
APCDD1LQ8NCL9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APCDD1LQ8NCL9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
APCDD1LQ8NCL9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APCDD1LQ8NCL9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
APCDD1LQ8NCL9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
APCDD1LQ8NCL9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
APCDD1LQ8NCL9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
APCDD1LQ8NCL9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
APCDD1LQ8NCL9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
APCDD1LQ8NCL9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
APCDD1LQ8NCL9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
APCDD1LQ8NCL9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APCDD1LQ8NCL9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APCDD1LQ8NCL9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
APCDD1LQ8NCL9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
APCDD1LQ8NCL9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
APCDD1LQ8NCL9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APCDD1LQ8NCL9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APCDD1LQ8NCL9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APCDD1LQ8NCL9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
APCDD1LQ8NCL9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APCDD1LQ8NCL9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
APCDD1LQ8NCL9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APCDD1LQ8NCL9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
APCDD1LQ8NCL9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APCDD1LQ8NCL9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
APCDD1LQ8NCL9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
APCDD1LQ8NCL9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
APCDD1LQ8NCL9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
APCDD1LQ8NCL9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
APCDD1LQ8NCL9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
APCDD1LQ8NCL9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
APCDD1LQ8NCL9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
APCDD1LQ8NCL9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
APCDD1LQ8NCL9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APCDD1LQ8NCL9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
APCDD1LQ8NCL9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
APCDD1LQ8NCL9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APCDD1LQ8NCL9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APCDD1LQ8NCL9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
APCDD1LQ8NCL9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APCDD1LQ8NCL9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APCDD1LQ8NCL9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
APCDD1LQ8NCL9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APCDD1LQ8NCL9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APCDD1LQ8NCL9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APCDD1LQ8NCL9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APCDD1LQ8NCL9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APCDD1LQ8NCL9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APCDD1LQ8NCL9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APCDD1LQ8NCL9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APCDD1LQ8NCL9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APCDD1LQ8NCL9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APCDD1LQ8NCL9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APCDD1LQ8NCL9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APCDD1LQ8NCL9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APCDD1LQ8NCL9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APCDD1LQ8NCL9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APCDD1LQ8NCL9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APCDD1LQ8NCL9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APCDD1LQ8NCL9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APCDD1LQ8NCL9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APCDD1LQ8NCL9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APCDD1LQ8NCL9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
APCDD1LQ8NCL9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APCDD1LQ8NCL9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APCDD1LQ8NCL9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APCDD1LQ8NCL9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APCDD1LQ8NCL9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
APCDD1LQ8NCL9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
APCDD1LQ8NCL9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APCDD1LQ8NCL9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms