Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBK3

SUMF1, Sulfatase-modifying factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMF1Q8NBK3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SUMF1Q8NBK3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SUMF1Q8NBK3 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SUMF1Q8NBK3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SUMF1Q8NBK3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SUMF1Q8NBK3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SUMF1Q8NBK3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SUMF1Q8NBK3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SUMF1Q8NBK3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SUMF1Q8NBK3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SUMF1Q8NBK3 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SUMF1Q8NBK3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SUMF1Q8NBK3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SUMF1Q8NBK3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SUMF1Q8NBK3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SUMF1Q8NBK3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SUMF1Q8NBK3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SUMF1Q8NBK3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SUMF1Q8NBK3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SUMF1Q8NBK3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SUMF1Q8NBK3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SUMF1Q8NBK3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SUMF1Q8NBK3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SUMF1Q8NBK3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SUMF1Q8NBK3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SUMF1Q8NBK3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SUMF1Q8NBK3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SUMF1Q8NBK3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SUMF1Q8NBK3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SUMF1Q8NBK3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SUMF1Q8NBK3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SUMF1Q8NBK3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SUMF1Q8NBK3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SUMF1Q8NBK3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SUMF1Q8NBK3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SUMF1Q8NBK3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SUMF1Q8NBK3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SUMF1Q8NBK3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SUMF1Q8NBK3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SUMF1Q8NBK3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SUMF1Q8NBK3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SUMF1Q8NBK3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SUMF1Q8NBK3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SUMF1Q8NBK3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SUMF1Q8NBK3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SUMF1Q8NBK3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SUMF1Q8NBK3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SUMF1Q8NBK3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SUMF1Q8NBK3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SUMF1Q8NBK3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SUMF1Q8NBK3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SUMF1Q8NBK3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SUMF1Q8NBK3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SUMF1Q8NBK3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SUMF1Q8NBK3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SUMF1Q8NBK3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SUMF1Q8NBK3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SUMF1Q8NBK3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SUMF1Q8NBK3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SUMF1Q8NBK3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SUMF1Q8NBK3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SUMF1Q8NBK3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SUMF1Q8NBK3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SUMF1Q8NBK3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SUMF1Q8NBK3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SUMF1Q8NBK3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SUMF1Q8NBK3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SUMF1Q8NBK3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SUMF1Q8NBK3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SUMF1Q8NBK3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SUMF1Q8NBK3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SUMF1Q8NBK3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SUMF1Q8NBK3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SUMF1Q8NBK3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SUMF1Q8NBK3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SUMF1Q8NBK3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SUMF1Q8NBK3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SUMF1Q8NBK3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SUMF1Q8NBK3 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SUMF1Q8NBK3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SUMF1Q8NBK3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SUMF1Q8NBK3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SUMF1Q8NBK3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SUMF1Q8NBK3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SUMF1Q8NBK3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SUMF1Q8NBK3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SUMF1Q8NBK3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SUMF1Q8NBK3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SUMF1Q8NBK3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SUMF1Q8NBK3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SUMF1Q8NBK3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SUMF1Q8NBK3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SUMF1Q8NBK3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SUMF1Q8NBK3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SUMF1Q8NBK3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SUMF1Q8NBK3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SUMF1Q8NBK3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SUMF1Q8NBK3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SUMF1Q8NBK3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SUMF1Q8NBK3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms