Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBE8

KLHL23, Kelch-like protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL23Q8NBE8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KLHL23Q8NBE8 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KLHL23Q8NBE8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KLHL23Q8NBE8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KLHL23Q8NBE8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KLHL23Q8NBE8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KLHL23Q8NBE8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KLHL23Q8NBE8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KLHL23Q8NBE8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KLHL23Q8NBE8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KLHL23Q8NBE8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KLHL23Q8NBE8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KLHL23Q8NBE8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KLHL23Q8NBE8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
KLHL23Q8NBE8 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KLHL23Q8NBE8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KLHL23Q8NBE8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KLHL23Q8NBE8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KLHL23Q8NBE8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KLHL23Q8NBE8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KLHL23Q8NBE8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KLHL23Q8NBE8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
KLHL23Q8NBE8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
KLHL23Q8NBE8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KLHL23Q8NBE8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
KLHL23Q8NBE8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
KLHL23Q8NBE8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
KLHL23Q8NBE8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
KLHL23Q8NBE8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KLHL23Q8NBE8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KLHL23Q8NBE8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KLHL23Q8NBE8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KLHL23Q8NBE8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KLHL23Q8NBE8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KLHL23Q8NBE8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KLHL23Q8NBE8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KLHL23Q8NBE8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KLHL23Q8NBE8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KLHL23Q8NBE8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KLHL23Q8NBE8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KLHL23Q8NBE8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KLHL23Q8NBE8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
KLHL23Q8NBE8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KLHL23Q8NBE8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
KLHL23Q8NBE8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KLHL23Q8NBE8 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KLHL23Q8NBE8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KLHL23Q8NBE8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KLHL23Q8NBE8 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KLHL23Q8NBE8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KLHL23Q8NBE8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KLHL23Q8NBE8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
KLHL23Q8NBE8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KLHL23Q8NBE8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KLHL23Q8NBE8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KLHL23Q8NBE8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KLHL23Q8NBE8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KLHL23Q8NBE8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
KLHL23Q8NBE8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KLHL23Q8NBE8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
KLHL23Q8NBE8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KLHL23Q8NBE8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KLHL23Q8NBE8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KLHL23Q8NBE8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
KLHL23Q8NBE8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KLHL23Q8NBE8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
KLHL23Q8NBE8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KLHL23Q8NBE8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KLHL23Q8NBE8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KLHL23Q8NBE8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KLHL23Q8NBE8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KLHL23Q8NBE8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KLHL23Q8NBE8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KLHL23Q8NBE8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KLHL23Q8NBE8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KLHL23Q8NBE8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KLHL23Q8NBE8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KLHL23Q8NBE8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
KLHL23Q8NBE8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KLHL23Q8NBE8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KLHL23Q8NBE8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
KLHL23Q8NBE8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KLHL23Q8NBE8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KLHL23Q8NBE8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KLHL23Q8NBE8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KLHL23Q8NBE8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KLHL23Q8NBE8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KLHL23Q8NBE8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KLHL23Q8NBE8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KLHL23Q8NBE8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KLHL23Q8NBE8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KLHL23Q8NBE8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
KLHL23Q8NBE8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KLHL23Q8NBE8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KLHL23Q8NBE8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KLHL23Q8NBE8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KLHL23Q8NBE8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KLHL23Q8NBE8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KLHL23Q8NBE8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KLHL23Q8NBE8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms