Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA03

FSIP1, Fibrous sheath-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSIP1Q8NA03 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FSIP1Q8NA03 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FSIP1Q8NA03 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FSIP1Q8NA03 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FSIP1Q8NA03 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FSIP1Q8NA03 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
FSIP1Q8NA03 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FSIP1Q8NA03 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FSIP1Q8NA03 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FSIP1Q8NA03 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FSIP1Q8NA03 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FSIP1Q8NA03 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FSIP1Q8NA03 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FSIP1Q8NA03 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FSIP1Q8NA03 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FSIP1Q8NA03 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FSIP1Q8NA03 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FSIP1Q8NA03 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FSIP1Q8NA03 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FSIP1Q8NA03 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FSIP1Q8NA03 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FSIP1Q8NA03 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FSIP1Q8NA03 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FSIP1Q8NA03 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FSIP1Q8NA03 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FSIP1Q8NA03 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
FSIP1Q8NA03 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FSIP1Q8NA03 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FSIP1Q8NA03 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FSIP1Q8NA03 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FSIP1Q8NA03 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FSIP1Q8NA03 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FSIP1Q8NA03 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FSIP1Q8NA03 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FSIP1Q8NA03 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FSIP1Q8NA03 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FSIP1Q8NA03 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FSIP1Q8NA03 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FSIP1Q8NA03 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
FSIP1Q8NA03 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
FSIP1Q8NA03 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
FSIP1Q8NA03 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
FSIP1Q8NA03 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
FSIP1Q8NA03 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FSIP1Q8NA03 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FSIP1Q8NA03 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FSIP1Q8NA03 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FSIP1Q8NA03 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FSIP1Q8NA03 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
FSIP1Q8NA03 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
FSIP1Q8NA03 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
FSIP1Q8NA03 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FSIP1Q8NA03 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
FSIP1Q8NA03 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
FSIP1Q8NA03 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FSIP1Q8NA03 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FSIP1Q8NA03 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FSIP1Q8NA03 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
FSIP1Q8NA03 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FSIP1Q8NA03 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FSIP1Q8NA03 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FSIP1Q8NA03 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FSIP1Q8NA03 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FSIP1Q8NA03 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FSIP1Q8NA03 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
FSIP1Q8NA03 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
FSIP1Q8NA03 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FSIP1Q8NA03 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
FSIP1Q8NA03 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
FSIP1Q8NA03 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
FSIP1Q8NA03 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
FSIP1Q8NA03 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
FSIP1Q8NA03 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
FSIP1Q8NA03 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
FSIP1Q8NA03 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FSIP1Q8NA03 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
FSIP1Q8NA03 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
FSIP1Q8NA03 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FSIP1Q8NA03 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FSIP1Q8NA03 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FSIP1Q8NA03 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FSIP1Q8NA03 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FSIP1Q8NA03 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
FSIP1Q8NA03 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FSIP1Q8NA03 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FSIP1Q8NA03 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FSIP1Q8NA03 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FSIP1Q8NA03 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FSIP1Q8NA03 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FSIP1Q8NA03 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FSIP1Q8NA03 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FSIP1Q8NA03 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FSIP1Q8NA03 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FSIP1Q8NA03 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FSIP1Q8NA03 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
FSIP1Q8NA03 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
FSIP1Q8NA03 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
FSIP1Q8NA03 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
FSIP1Q8NA03 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
FSIP1Q8NA03 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms