Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9F7

GDPD1, Lysophospholipase D GDPD1, humanhuman

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Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD1Q8N9F7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GDPD1Q8N9F7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GDPD1Q8N9F7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GDPD1Q8N9F7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GDPD1Q8N9F7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GDPD1Q8N9F7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GDPD1Q8N9F7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GDPD1Q8N9F7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GDPD1Q8N9F7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GDPD1Q8N9F7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GDPD1Q8N9F7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GDPD1Q8N9F7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GDPD1Q8N9F7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GDPD1Q8N9F7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GDPD1Q8N9F7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GDPD1Q8N9F7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GDPD1Q8N9F7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GDPD1Q8N9F7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GDPD1Q8N9F7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GDPD1Q8N9F7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GDPD1Q8N9F7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GDPD1Q8N9F7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GDPD1Q8N9F7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GDPD1Q8N9F7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GDPD1Q8N9F7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GDPD1Q8N9F7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GDPD1Q8N9F7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GDPD1Q8N9F7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GDPD1Q8N9F7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GDPD1Q8N9F7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GDPD1Q8N9F7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GDPD1Q8N9F7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GDPD1Q8N9F7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GDPD1Q8N9F7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GDPD1Q8N9F7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GDPD1Q8N9F7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GDPD1Q8N9F7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GDPD1Q8N9F7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GDPD1Q8N9F7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GDPD1Q8N9F7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GDPD1Q8N9F7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GDPD1Q8N9F7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GDPD1Q8N9F7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GDPD1Q8N9F7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GDPD1Q8N9F7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GDPD1Q8N9F7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GDPD1Q8N9F7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GDPD1Q8N9F7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GDPD1Q8N9F7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GDPD1Q8N9F7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GDPD1Q8N9F7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GDPD1Q8N9F7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GDPD1Q8N9F7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GDPD1Q8N9F7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GDPD1Q8N9F7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GDPD1Q8N9F7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GDPD1Q8N9F7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GDPD1Q8N9F7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDPD1Q8N9F7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDPD1Q8N9F7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDPD1Q8N9F7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDPD1Q8N9F7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDPD1Q8N9F7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDPD1Q8N9F7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDPD1Q8N9F7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GDPD1Q8N9F7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GDPD1Q8N9F7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GDPD1Q8N9F7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GDPD1Q8N9F7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GDPD1Q8N9F7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDPD1Q8N9F7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDPD1Q8N9F7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDPD1Q8N9F7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDPD1Q8N9F7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDPD1Q8N9F7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDPD1Q8N9F7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDPD1Q8N9F7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDPD1Q8N9F7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDPD1Q8N9F7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDPD1Q8N9F7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDPD1Q8N9F7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDPD1Q8N9F7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDPD1Q8N9F7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDPD1Q8N9F7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GDPD1Q8N9F7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GDPD1Q8N9F7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GDPD1Q8N9F7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GDPD1Q8N9F7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GDPD1Q8N9F7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GDPD1Q8N9F7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDPD1Q8N9F7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDPD1Q8N9F7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDPD1Q8N9F7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GDPD1Q8N9F7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDPD1Q8N9F7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDPD1Q8N9F7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GDPD1Q8N9F7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GDPD1Q8N9F7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GDPD1Q8N9F7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GDPD1Q8N9F7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
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