Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXF0

NPAS3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS3Q8IXF0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
NPAS3Q8IXF0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NPAS3Q8IXF0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NPAS3Q8IXF0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NPAS3Q8IXF0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NPAS3Q8IXF0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NPAS3Q8IXF0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NPAS3Q8IXF0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
NPAS3Q8IXF0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
NPAS3Q8IXF0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NPAS3Q8IXF0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NPAS3Q8IXF0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NPAS3Q8IXF0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NPAS3Q8IXF0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
NPAS3Q8IXF0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NPAS3Q8IXF0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NPAS3Q8IXF0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NPAS3Q8IXF0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NPAS3Q8IXF0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NPAS3Q8IXF0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NPAS3Q8IXF0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NPAS3Q8IXF0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NPAS3Q8IXF0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NPAS3Q8IXF0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NPAS3Q8IXF0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
NPAS3Q8IXF0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
NPAS3Q8IXF0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NPAS3Q8IXF0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NPAS3Q8IXF0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NPAS3Q8IXF0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NPAS3Q8IXF0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NPAS3Q8IXF0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NPAS3Q8IXF0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NPAS3Q8IXF0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NPAS3Q8IXF0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NPAS3Q8IXF0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NPAS3Q8IXF0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NPAS3Q8IXF0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NPAS3Q8IXF0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NPAS3Q8IXF0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NPAS3Q8IXF0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NPAS3Q8IXF0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NPAS3Q8IXF0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
NPAS3Q8IXF0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NPAS3Q8IXF0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NPAS3Q8IXF0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
NPAS3Q8IXF0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NPAS3Q8IXF0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
NPAS3Q8IXF0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NPAS3Q8IXF0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NPAS3Q8IXF0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NPAS3Q8IXF0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
NPAS3Q8IXF0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NPAS3Q8IXF0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NPAS3Q8IXF0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NPAS3Q8IXF0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NPAS3Q8IXF0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NPAS3Q8IXF0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NPAS3Q8IXF0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NPAS3Q8IXF0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NPAS3Q8IXF0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NPAS3Q8IXF0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NPAS3Q8IXF0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NPAS3Q8IXF0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NPAS3Q8IXF0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NPAS3Q8IXF0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NPAS3Q8IXF0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NPAS3Q8IXF0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NPAS3Q8IXF0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NPAS3Q8IXF0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NPAS3Q8IXF0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NPAS3Q8IXF0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NPAS3Q8IXF0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NPAS3Q8IXF0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NPAS3Q8IXF0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NPAS3Q8IXF0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NPAS3Q8IXF0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NPAS3Q8IXF0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NPAS3Q8IXF0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NPAS3Q8IXF0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NPAS3Q8IXF0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NPAS3Q8IXF0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NPAS3Q8IXF0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NPAS3Q8IXF0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NPAS3Q8IXF0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NPAS3Q8IXF0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NPAS3Q8IXF0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NPAS3Q8IXF0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NPAS3Q8IXF0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NPAS3Q8IXF0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NPAS3Q8IXF0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NPAS3Q8IXF0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NPAS3Q8IXF0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NPAS3Q8IXF0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NPAS3Q8IXF0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NPAS3Q8IXF0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
NPAS3Q8IXF0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
NPAS3Q8IXF0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NPAS3Q8IXF0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NPAS3Q8IXF0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms