Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HERC6Q8IVU3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HERC6Q8IVU3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HERC6Q8IVU3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HERC6Q8IVU3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HERC6Q8IVU3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HERC6Q8IVU3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
HERC6Q8IVU3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HERC6Q8IVU3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HERC6Q8IVU3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HERC6Q8IVU3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HERC6Q8IVU3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HERC6Q8IVU3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HERC6Q8IVU3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HERC6Q8IVU3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HERC6Q8IVU3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HERC6Q8IVU3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HERC6Q8IVU3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
HERC6Q8IVU3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HERC6Q8IVU3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HERC6Q8IVU3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HERC6Q8IVU3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
HERC6Q8IVU3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
HERC6Q8IVU3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HERC6Q8IVU3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HERC6Q8IVU3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
HERC6Q8IVU3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HERC6Q8IVU3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HERC6Q8IVU3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HERC6Q8IVU3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HERC6Q8IVU3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HERC6Q8IVU3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HERC6Q8IVU3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
HERC6Q8IVU3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HERC6Q8IVU3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HERC6Q8IVU3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HERC6Q8IVU3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
HERC6Q8IVU3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HERC6Q8IVU3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
HERC6Q8IVU3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HERC6Q8IVU3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HERC6Q8IVU3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HERC6Q8IVU3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
HERC6Q8IVU3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HERC6Q8IVU3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
HERC6Q8IVU3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
HERC6Q8IVU3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
HERC6Q8IVU3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
HERC6Q8IVU3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HERC6Q8IVU3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HERC6Q8IVU3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HERC6Q8IVU3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HERC6Q8IVU3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HERC6Q8IVU3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
HERC6Q8IVU3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HERC6Q8IVU3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HERC6Q8IVU3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HERC6Q8IVU3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HERC6Q8IVU3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HERC6Q8IVU3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HERC6Q8IVU3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HERC6Q8IVU3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HERC6Q8IVU3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HERC6Q8IVU3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HERC6Q8IVU3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HERC6Q8IVU3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HERC6Q8IVU3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HERC6Q8IVU3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HERC6Q8IVU3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HERC6Q8IVU3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HERC6Q8IVU3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HERC6Q8IVU3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HERC6Q8IVU3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HERC6Q8IVU3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HERC6Q8IVU3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HERC6Q8IVU3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HERC6Q8IVU3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HERC6Q8IVU3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HERC6Q8IVU3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HERC6Q8IVU3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HERC6Q8IVU3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HERC6Q8IVU3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HERC6Q8IVU3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HERC6Q8IVU3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HERC6Q8IVU3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HERC6Q8IVU3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HERC6Q8IVU3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HERC6Q8IVU3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HERC6Q8IVU3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HERC6Q8IVU3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HERC6Q8IVU3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HERC6Q8IVU3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HERC6Q8IVU3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HERC6Q8IVU3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HERC6Q8IVU3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HERC6Q8IVU3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HERC6Q8IVU3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HERC6Q8IVU3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HERC6Q8IVU3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HERC6Q8IVU3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms