Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUQ0

CLVS1, Clavesin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1Q8IUQ0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLVS1Q8IUQ0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLVS1Q8IUQ0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLVS1Q8IUQ0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLVS1Q8IUQ0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLVS1Q8IUQ0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLVS1Q8IUQ0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLVS1Q8IUQ0 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLVS1Q8IUQ0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLVS1Q8IUQ0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLVS1Q8IUQ0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLVS1Q8IUQ0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLVS1Q8IUQ0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CLVS1Q8IUQ0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLVS1Q8IUQ0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLVS1Q8IUQ0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLVS1Q8IUQ0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLVS1Q8IUQ0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLVS1Q8IUQ0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLVS1Q8IUQ0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLVS1Q8IUQ0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLVS1Q8IUQ0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLVS1Q8IUQ0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLVS1Q8IUQ0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLVS1Q8IUQ0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLVS1Q8IUQ0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLVS1Q8IUQ0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLVS1Q8IUQ0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLVS1Q8IUQ0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLVS1Q8IUQ0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLVS1Q8IUQ0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLVS1Q8IUQ0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CLVS1Q8IUQ0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLVS1Q8IUQ0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CLVS1Q8IUQ0 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLVS1Q8IUQ0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLVS1Q8IUQ0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLVS1Q8IUQ0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLVS1Q8IUQ0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLVS1Q8IUQ0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLVS1Q8IUQ0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLVS1Q8IUQ0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CLVS1Q8IUQ0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLVS1Q8IUQ0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLVS1Q8IUQ0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLVS1Q8IUQ0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLVS1Q8IUQ0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CLVS1Q8IUQ0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLVS1Q8IUQ0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CLVS1Q8IUQ0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLVS1Q8IUQ0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CLVS1Q8IUQ0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLVS1Q8IUQ0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLVS1Q8IUQ0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLVS1Q8IUQ0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLVS1Q8IUQ0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLVS1Q8IUQ0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLVS1Q8IUQ0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLVS1Q8IUQ0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLVS1Q8IUQ0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLVS1Q8IUQ0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLVS1Q8IUQ0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLVS1Q8IUQ0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLVS1Q8IUQ0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLVS1Q8IUQ0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLVS1Q8IUQ0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLVS1Q8IUQ0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLVS1Q8IUQ0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLVS1Q8IUQ0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLVS1Q8IUQ0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLVS1Q8IUQ0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLVS1Q8IUQ0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLVS1Q8IUQ0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLVS1Q8IUQ0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLVS1Q8IUQ0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLVS1Q8IUQ0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLVS1Q8IUQ0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLVS1Q8IUQ0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CLVS1Q8IUQ0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CLVS1Q8IUQ0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLVS1Q8IUQ0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLVS1Q8IUQ0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLVS1Q8IUQ0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLVS1Q8IUQ0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLVS1Q8IUQ0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLVS1Q8IUQ0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLVS1Q8IUQ0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLVS1Q8IUQ0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLVS1Q8IUQ0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLVS1Q8IUQ0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLVS1Q8IUQ0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLVS1Q8IUQ0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLVS1Q8IUQ0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLVS1Q8IUQ0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLVS1Q8IUQ0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLVS1Q8IUQ0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLVS1Q8IUQ0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLVS1Q8IUQ0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLVS1Q8IUQ0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLVS1Q8IUQ0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms