Protein–RNA interactions for Protein: Q7L1S5

CHST9, Carbohydrate sulfotransferase 9, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST9Q7L1S5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHST9Q7L1S5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHST9Q7L1S5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHST9Q7L1S5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHST9Q7L1S5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHST9Q7L1S5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHST9Q7L1S5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHST9Q7L1S5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHST9Q7L1S5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHST9Q7L1S5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHST9Q7L1S5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHST9Q7L1S5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHST9Q7L1S5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHST9Q7L1S5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHST9Q7L1S5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHST9Q7L1S5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHST9Q7L1S5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHST9Q7L1S5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHST9Q7L1S5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHST9Q7L1S5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHST9Q7L1S5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHST9Q7L1S5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHST9Q7L1S5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHST9Q7L1S5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHST9Q7L1S5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHST9Q7L1S5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHST9Q7L1S5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHST9Q7L1S5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CHST9Q7L1S5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHST9Q7L1S5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHST9Q7L1S5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHST9Q7L1S5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHST9Q7L1S5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHST9Q7L1S5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHST9Q7L1S5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHST9Q7L1S5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHST9Q7L1S5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHST9Q7L1S5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHST9Q7L1S5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHST9Q7L1S5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHST9Q7L1S5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHST9Q7L1S5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHST9Q7L1S5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHST9Q7L1S5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHST9Q7L1S5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHST9Q7L1S5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHST9Q7L1S5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHST9Q7L1S5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHST9Q7L1S5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHST9Q7L1S5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHST9Q7L1S5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHST9Q7L1S5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHST9Q7L1S5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHST9Q7L1S5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHST9Q7L1S5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHST9Q7L1S5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHST9Q7L1S5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CHST9Q7L1S5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
CHST9Q7L1S5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CHST9Q7L1S5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CHST9Q7L1S5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CHST9Q7L1S5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHST9Q7L1S5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHST9Q7L1S5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CHST9Q7L1S5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHST9Q7L1S5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHST9Q7L1S5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CHST9Q7L1S5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHST9Q7L1S5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHST9Q7L1S5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHST9Q7L1S5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHST9Q7L1S5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHST9Q7L1S5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHST9Q7L1S5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHST9Q7L1S5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHST9Q7L1S5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHST9Q7L1S5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHST9Q7L1S5 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHST9Q7L1S5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHST9Q7L1S5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHST9Q7L1S5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHST9Q7L1S5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHST9Q7L1S5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CHST9Q7L1S5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHST9Q7L1S5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHST9Q7L1S5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHST9Q7L1S5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHST9Q7L1S5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHST9Q7L1S5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CHST9Q7L1S5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHST9Q7L1S5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHST9Q7L1S5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHST9Q7L1S5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHST9Q7L1S5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHST9Q7L1S5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHST9Q7L1S5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHST9Q7L1S5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHST9Q7L1S5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHST9Q7L1S5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHST9Q7L1S5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 261.8 ms