Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
HECW1Q76N89 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
HECW1Q76N89 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC39.16■■■■□ 3.86
HECW1Q76N89 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
HECW1Q76N89 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC39.16■■■■□ 3.86
HECW1Q76N89 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC39.16■■■■□ 3.86
HECW1Q76N89 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC39.15■■■■□ 3.86
HECW1Q76N89 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
HECW1Q76N89 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC39.14■■■■□ 3.86
HECW1Q76N89 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
HECW1Q76N89 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
HECW1Q76N89 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
HECW1Q76N89 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC39.11■■■■□ 3.85
HECW1Q76N89 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
HECW1Q76N89 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
HECW1Q76N89 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
HECW1Q76N89 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC39.09■■■■□ 3.85
HECW1Q76N89 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC39.08■■■■□ 3.85
HECW1Q76N89 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
HECW1Q76N89 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
HECW1Q76N89 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
HECW1Q76N89 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
HECW1Q76N89 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.84
HECW1Q76N89 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.84
HECW1Q76N89 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
HECW1Q76N89 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
HECW1Q76N89 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
HECW1Q76N89 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC39.05■■■■□ 3.84
HECW1Q76N89 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.04■■■■□ 3.84
HECW1Q76N89 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
HECW1Q76N89 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
HECW1Q76N89 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
HECW1Q76N89 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC39.03■■■■□ 3.84
HECW1Q76N89 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
HECW1Q76N89 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC39.03■■■■□ 3.84
HECW1Q76N89 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC39.02■■■■□ 3.84
HECW1Q76N89 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
HECW1Q76N89 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC39.02■■■■□ 3.84
HECW1Q76N89 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC39.02■■■■□ 3.84
HECW1Q76N89 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC39.01■■■■□ 3.84
HECW1Q76N89 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC39.01■■■■□ 3.84
HECW1Q76N89 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC39■■■■□ 3.83
HECW1Q76N89 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC39■■■■□ 3.83
HECW1Q76N89 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
HECW1Q76N89 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
HECW1Q76N89 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39■■■■□ 3.83
HECW1Q76N89 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC38.99■■■■□ 3.83
HECW1Q76N89 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC38.99■■■■□ 3.83
HECW1Q76N89 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
HECW1Q76N89 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.99■■■■□ 3.83
HECW1Q76N89 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
HECW1Q76N89 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC38.98■■■■□ 3.83
HECW1Q76N89 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
HECW1Q76N89 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC38.97■■■■□ 3.83
HECW1Q76N89 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC38.97■■■■□ 3.83
HECW1Q76N89 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
HECW1Q76N89 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.96■■■■□ 3.83
HECW1Q76N89 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC38.96■■■■□ 3.83
HECW1Q76N89 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC38.94■■■■□ 3.82
HECW1Q76N89 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC38.94■■■■□ 3.82
HECW1Q76N89 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC38.94■■■■□ 3.82
HECW1Q76N89 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC38.94■■■■□ 3.82
HECW1Q76N89 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
HECW1Q76N89 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.93■■■■□ 3.82
HECW1Q76N89 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC38.92■■■■□ 3.82
HECW1Q76N89 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
HECW1Q76N89 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
HECW1Q76N89 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
HECW1Q76N89 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
HECW1Q76N89 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC38.91■■■■□ 3.82
HECW1Q76N89 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
HECW1Q76N89 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC38.91■■■■□ 3.82
HECW1Q76N89 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
HECW1Q76N89 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
HECW1Q76N89 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
HECW1Q76N89 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
HECW1Q76N89 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
HECW1Q76N89 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.88■■■■□ 3.81
HECW1Q76N89 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
HECW1Q76N89 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
HECW1Q76N89 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
HECW1Q76N89 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC38.87■■■■□ 3.81
HECW1Q76N89 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC38.87■■■■□ 3.81
HECW1Q76N89 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
HECW1Q76N89 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
HECW1Q76N89 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC38.86■■■■□ 3.81
HECW1Q76N89 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
HECW1Q76N89 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
HECW1Q76N89 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
HECW1Q76N89 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
HECW1Q76N89 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC38.85■■■■□ 3.81
HECW1Q76N89 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC38.84■■■■□ 3.81
HECW1Q76N89 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.84■■■■□ 3.81
HECW1Q76N89 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
HECW1Q76N89 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC38.83■■■■□ 3.81
HECW1Q76N89 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC38.83■■■■□ 3.81
HECW1Q76N89 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
HECW1Q76N89 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC38.83■■■■□ 3.81
HECW1Q76N89 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC38.83■■■■□ 3.81
HECW1Q76N89 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC38.83■■■■□ 3.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms