Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV65

FAM47E, Protein FAM47E, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47EQ6ZV65 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FAM47EQ6ZV65 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FAM47EQ6ZV65 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FAM47EQ6ZV65 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FAM47EQ6ZV65 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM47EQ6ZV65 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM47EQ6ZV65 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM47EQ6ZV65 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM47EQ6ZV65 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM47EQ6ZV65 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM47EQ6ZV65 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM47EQ6ZV65 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM47EQ6ZV65 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM47EQ6ZV65 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM47EQ6ZV65 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM47EQ6ZV65 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM47EQ6ZV65 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM47EQ6ZV65 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM47EQ6ZV65 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM47EQ6ZV65 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM47EQ6ZV65 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM47EQ6ZV65 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM47EQ6ZV65 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM47EQ6ZV65 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM47EQ6ZV65 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM47EQ6ZV65 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM47EQ6ZV65 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM47EQ6ZV65 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM47EQ6ZV65 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM47EQ6ZV65 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM47EQ6ZV65 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM47EQ6ZV65 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM47EQ6ZV65 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM47EQ6ZV65 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM47EQ6ZV65 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM47EQ6ZV65 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
FAM47EQ6ZV65 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
FAM47EQ6ZV65 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM47EQ6ZV65 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM47EQ6ZV65 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM47EQ6ZV65 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM47EQ6ZV65 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM47EQ6ZV65 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM47EQ6ZV65 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM47EQ6ZV65 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM47EQ6ZV65 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM47EQ6ZV65 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM47EQ6ZV65 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM47EQ6ZV65 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM47EQ6ZV65 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM47EQ6ZV65 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM47EQ6ZV65 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM47EQ6ZV65 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM47EQ6ZV65 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM47EQ6ZV65 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM47EQ6ZV65 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM47EQ6ZV65 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM47EQ6ZV65 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM47EQ6ZV65 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM47EQ6ZV65 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM47EQ6ZV65 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM47EQ6ZV65 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM47EQ6ZV65 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM47EQ6ZV65 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM47EQ6ZV65 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM47EQ6ZV65 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM47EQ6ZV65 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM47EQ6ZV65 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM47EQ6ZV65 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM47EQ6ZV65 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM47EQ6ZV65 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM47EQ6ZV65 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM47EQ6ZV65 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM47EQ6ZV65 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM47EQ6ZV65 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM47EQ6ZV65 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM47EQ6ZV65 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM47EQ6ZV65 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM47EQ6ZV65 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM47EQ6ZV65 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM47EQ6ZV65 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM47EQ6ZV65 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM47EQ6ZV65 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM47EQ6ZV65 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM47EQ6ZV65 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM47EQ6ZV65 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM47EQ6ZV65 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM47EQ6ZV65 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM47EQ6ZV65 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM47EQ6ZV65 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM47EQ6ZV65 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM47EQ6ZV65 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM47EQ6ZV65 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM47EQ6ZV65 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM47EQ6ZV65 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM47EQ6ZV65 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM47EQ6ZV65 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM47EQ6ZV65 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM47EQ6ZV65 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM47EQ6ZV65 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms