Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTR5

CFAP47, Cilia- and flagella-associated protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 3,102 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP47Q6ZTR5 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CFAP47Q6ZTR5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CFAP47Q6ZTR5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CFAP47Q6ZTR5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CFAP47Q6ZTR5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CFAP47Q6ZTR5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CFAP47Q6ZTR5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CFAP47Q6ZTR5 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CFAP47Q6ZTR5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CFAP47Q6ZTR5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CFAP47Q6ZTR5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CFAP47Q6ZTR5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CFAP47Q6ZTR5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CFAP47Q6ZTR5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CFAP47Q6ZTR5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CFAP47Q6ZTR5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CFAP47Q6ZTR5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CFAP47Q6ZTR5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CFAP47Q6ZTR5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CFAP47Q6ZTR5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CFAP47Q6ZTR5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP47Q6ZTR5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP47Q6ZTR5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP47Q6ZTR5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP47Q6ZTR5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP47Q6ZTR5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP47Q6ZTR5 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP47Q6ZTR5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP47Q6ZTR5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP47Q6ZTR5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP47Q6ZTR5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CFAP47Q6ZTR5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CFAP47Q6ZTR5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CFAP47Q6ZTR5 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP47Q6ZTR5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP47Q6ZTR5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP47Q6ZTR5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CFAP47Q6ZTR5 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CFAP47Q6ZTR5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CFAP47Q6ZTR5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CFAP47Q6ZTR5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CFAP47Q6ZTR5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CFAP47Q6ZTR5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CFAP47Q6ZTR5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CFAP47Q6ZTR5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CFAP47Q6ZTR5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CFAP47Q6ZTR5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CFAP47Q6ZTR5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CFAP47Q6ZTR5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CFAP47Q6ZTR5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CFAP47Q6ZTR5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CFAP47Q6ZTR5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CFAP47Q6ZTR5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CFAP47Q6ZTR5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CFAP47Q6ZTR5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CFAP47Q6ZTR5 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CFAP47Q6ZTR5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CFAP47Q6ZTR5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CFAP47Q6ZTR5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CFAP47Q6ZTR5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CFAP47Q6ZTR5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CFAP47Q6ZTR5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CFAP47Q6ZTR5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CFAP47Q6ZTR5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CFAP47Q6ZTR5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CFAP47Q6ZTR5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CFAP47Q6ZTR5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CFAP47Q6ZTR5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CFAP47Q6ZTR5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CFAP47Q6ZTR5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CFAP47Q6ZTR5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CFAP47Q6ZTR5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CFAP47Q6ZTR5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CFAP47Q6ZTR5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP47Q6ZTR5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP47Q6ZTR5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP47Q6ZTR5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP47Q6ZTR5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP47Q6ZTR5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP47Q6ZTR5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP47Q6ZTR5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP47Q6ZTR5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP47Q6ZTR5 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP47Q6ZTR5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP47Q6ZTR5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP47Q6ZTR5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP47Q6ZTR5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP47Q6ZTR5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP47Q6ZTR5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CFAP47Q6ZTR5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CFAP47Q6ZTR5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CFAP47Q6ZTR5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CFAP47Q6ZTR5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CFAP47Q6ZTR5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CFAP47Q6ZTR5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CFAP47Q6ZTR5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CFAP47Q6ZTR5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CFAP47Q6ZTR5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CFAP47Q6ZTR5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CFAP47Q6ZTR5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
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