Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR5

TMEM136, Transmembrane protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM136Q6ZRR5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM136Q6ZRR5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM136Q6ZRR5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM136Q6ZRR5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM136Q6ZRR5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM136Q6ZRR5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM136Q6ZRR5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM136Q6ZRR5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM136Q6ZRR5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM136Q6ZRR5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM136Q6ZRR5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM136Q6ZRR5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM136Q6ZRR5 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM136Q6ZRR5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM136Q6ZRR5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM136Q6ZRR5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM136Q6ZRR5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM136Q6ZRR5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM136Q6ZRR5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM136Q6ZRR5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM136Q6ZRR5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM136Q6ZRR5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM136Q6ZRR5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM136Q6ZRR5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM136Q6ZRR5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM136Q6ZRR5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM136Q6ZRR5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM136Q6ZRR5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM136Q6ZRR5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM136Q6ZRR5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM136Q6ZRR5 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM136Q6ZRR5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM136Q6ZRR5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM136Q6ZRR5 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM136Q6ZRR5 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM136Q6ZRR5 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM136Q6ZRR5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM136Q6ZRR5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM136Q6ZRR5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM136Q6ZRR5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM136Q6ZRR5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM136Q6ZRR5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM136Q6ZRR5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM136Q6ZRR5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM136Q6ZRR5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM136Q6ZRR5 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM136Q6ZRR5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM136Q6ZRR5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM136Q6ZRR5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM136Q6ZRR5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM136Q6ZRR5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM136Q6ZRR5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM136Q6ZRR5 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM136Q6ZRR5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM136Q6ZRR5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM136Q6ZRR5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM136Q6ZRR5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM136Q6ZRR5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM136Q6ZRR5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM136Q6ZRR5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM136Q6ZRR5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM136Q6ZRR5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM136Q6ZRR5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM136Q6ZRR5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM136Q6ZRR5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM136Q6ZRR5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM136Q6ZRR5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM136Q6ZRR5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM136Q6ZRR5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM136Q6ZRR5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM136Q6ZRR5 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM136Q6ZRR5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM136Q6ZRR5 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM136Q6ZRR5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM136Q6ZRR5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM136Q6ZRR5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM136Q6ZRR5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM136Q6ZRR5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM136Q6ZRR5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TMEM136Q6ZRR5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TMEM136Q6ZRR5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM136Q6ZRR5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM136Q6ZRR5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM136Q6ZRR5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM136Q6ZRR5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM136Q6ZRR5 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM136Q6ZRR5 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM136Q6ZRR5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM136Q6ZRR5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM136Q6ZRR5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM136Q6ZRR5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM136Q6ZRR5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM136Q6ZRR5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM136Q6ZRR5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM136Q6ZRR5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM136Q6ZRR5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM136Q6ZRR5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM136Q6ZRR5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM136Q6ZRR5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM136Q6ZRR5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms