Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN54

DEF8, Differentially expressed in FDCP 8 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEF8Q6ZN54 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DEF8Q6ZN54 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DEF8Q6ZN54 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
DEF8Q6ZN54 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
DEF8Q6ZN54 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DEF8Q6ZN54 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DEF8Q6ZN54 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DEF8Q6ZN54 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DEF8Q6ZN54 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
DEF8Q6ZN54 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DEF8Q6ZN54 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DEF8Q6ZN54 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DEF8Q6ZN54 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DEF8Q6ZN54 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
DEF8Q6ZN54 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DEF8Q6ZN54 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DEF8Q6ZN54 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DEF8Q6ZN54 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DEF8Q6ZN54 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DEF8Q6ZN54 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DEF8Q6ZN54 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DEF8Q6ZN54 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DEF8Q6ZN54 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DEF8Q6ZN54 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DEF8Q6ZN54 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DEF8Q6ZN54 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DEF8Q6ZN54 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DEF8Q6ZN54 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DEF8Q6ZN54 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DEF8Q6ZN54 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DEF8Q6ZN54 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DEF8Q6ZN54 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DEF8Q6ZN54 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DEF8Q6ZN54 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DEF8Q6ZN54 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DEF8Q6ZN54 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DEF8Q6ZN54 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
DEF8Q6ZN54 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DEF8Q6ZN54 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DEF8Q6ZN54 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DEF8Q6ZN54 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DEF8Q6ZN54 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DEF8Q6ZN54 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DEF8Q6ZN54 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DEF8Q6ZN54 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DEF8Q6ZN54 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DEF8Q6ZN54 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DEF8Q6ZN54 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DEF8Q6ZN54 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DEF8Q6ZN54 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DEF8Q6ZN54 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DEF8Q6ZN54 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DEF8Q6ZN54 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DEF8Q6ZN54 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DEF8Q6ZN54 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DEF8Q6ZN54 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DEF8Q6ZN54 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DEF8Q6ZN54 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DEF8Q6ZN54 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DEF8Q6ZN54 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DEF8Q6ZN54 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DEF8Q6ZN54 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DEF8Q6ZN54 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DEF8Q6ZN54 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DEF8Q6ZN54 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DEF8Q6ZN54 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DEF8Q6ZN54 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DEF8Q6ZN54 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DEF8Q6ZN54 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DEF8Q6ZN54 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DEF8Q6ZN54 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DEF8Q6ZN54 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DEF8Q6ZN54 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DEF8Q6ZN54 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DEF8Q6ZN54 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DEF8Q6ZN54 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DEF8Q6ZN54 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DEF8Q6ZN54 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DEF8Q6ZN54 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DEF8Q6ZN54 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DEF8Q6ZN54 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DEF8Q6ZN54 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DEF8Q6ZN54 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DEF8Q6ZN54 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DEF8Q6ZN54 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DEF8Q6ZN54 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DEF8Q6ZN54 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DEF8Q6ZN54 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DEF8Q6ZN54 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DEF8Q6ZN54 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DEF8Q6ZN54 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DEF8Q6ZN54 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DEF8Q6ZN54 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DEF8Q6ZN54 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
DEF8Q6ZN54 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DEF8Q6ZN54 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DEF8Q6ZN54 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DEF8Q6ZN54 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DEF8Q6ZN54 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DEF8Q6ZN54 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms