Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXY8

TMC5, Transmembrane channel-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC5Q6UXY8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMC5Q6UXY8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMC5Q6UXY8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMC5Q6UXY8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMC5Q6UXY8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMC5Q6UXY8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMC5Q6UXY8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMC5Q6UXY8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TMC5Q6UXY8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TMC5Q6UXY8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TMC5Q6UXY8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMC5Q6UXY8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMC5Q6UXY8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMC5Q6UXY8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMC5Q6UXY8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMC5Q6UXY8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMC5Q6UXY8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMC5Q6UXY8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TMC5Q6UXY8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TMC5Q6UXY8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMC5Q6UXY8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMC5Q6UXY8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMC5Q6UXY8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMC5Q6UXY8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
TMC5Q6UXY8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMC5Q6UXY8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMC5Q6UXY8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMC5Q6UXY8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMC5Q6UXY8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMC5Q6UXY8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMC5Q6UXY8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMC5Q6UXY8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMC5Q6UXY8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMC5Q6UXY8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMC5Q6UXY8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMC5Q6UXY8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMC5Q6UXY8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMC5Q6UXY8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMC5Q6UXY8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMC5Q6UXY8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMC5Q6UXY8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMC5Q6UXY8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMC5Q6UXY8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMC5Q6UXY8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TMC5Q6UXY8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TMC5Q6UXY8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TMC5Q6UXY8 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMC5Q6UXY8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMC5Q6UXY8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMC5Q6UXY8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TMC5Q6UXY8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMC5Q6UXY8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMC5Q6UXY8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMC5Q6UXY8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TMC5Q6UXY8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMC5Q6UXY8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMC5Q6UXY8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMC5Q6UXY8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TMC5Q6UXY8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMC5Q6UXY8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMC5Q6UXY8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMC5Q6UXY8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMC5Q6UXY8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMC5Q6UXY8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMC5Q6UXY8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMC5Q6UXY8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMC5Q6UXY8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMC5Q6UXY8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMC5Q6UXY8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TMC5Q6UXY8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMC5Q6UXY8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMC5Q6UXY8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMC5Q6UXY8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMC5Q6UXY8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMC5Q6UXY8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMC5Q6UXY8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMC5Q6UXY8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMC5Q6UXY8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMC5Q6UXY8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMC5Q6UXY8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TMC5Q6UXY8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMC5Q6UXY8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMC5Q6UXY8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMC5Q6UXY8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMC5Q6UXY8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMC5Q6UXY8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMC5Q6UXY8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMC5Q6UXY8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TMC5Q6UXY8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
TMC5Q6UXY8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMC5Q6UXY8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMC5Q6UXY8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMC5Q6UXY8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMC5Q6UXY8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMC5Q6UXY8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMC5Q6UXY8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMC5Q6UXY8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMC5Q6UXY8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMC5Q6UXY8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMC5Q6UXY8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms