Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXI7

VIT, Vitrin, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VITQ6UXI7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VITQ6UXI7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VITQ6UXI7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VITQ6UXI7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VITQ6UXI7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VITQ6UXI7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VITQ6UXI7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
VITQ6UXI7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VITQ6UXI7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VITQ6UXI7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VITQ6UXI7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
VITQ6UXI7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
VITQ6UXI7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VITQ6UXI7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VITQ6UXI7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VITQ6UXI7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VITQ6UXI7 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VITQ6UXI7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VITQ6UXI7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VITQ6UXI7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VITQ6UXI7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VITQ6UXI7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
VITQ6UXI7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
VITQ6UXI7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
VITQ6UXI7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
VITQ6UXI7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
VITQ6UXI7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VITQ6UXI7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VITQ6UXI7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VITQ6UXI7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VITQ6UXI7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VITQ6UXI7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VITQ6UXI7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VITQ6UXI7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
VITQ6UXI7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VITQ6UXI7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VITQ6UXI7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VITQ6UXI7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
VITQ6UXI7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
VITQ6UXI7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VITQ6UXI7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VITQ6UXI7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VITQ6UXI7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VITQ6UXI7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VITQ6UXI7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VITQ6UXI7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VITQ6UXI7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VITQ6UXI7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VITQ6UXI7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VITQ6UXI7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
VITQ6UXI7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
VITQ6UXI7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VITQ6UXI7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
VITQ6UXI7 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VITQ6UXI7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VITQ6UXI7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VITQ6UXI7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VITQ6UXI7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VITQ6UXI7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VITQ6UXI7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VITQ6UXI7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VITQ6UXI7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VITQ6UXI7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VITQ6UXI7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
VITQ6UXI7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VITQ6UXI7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VITQ6UXI7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VITQ6UXI7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VITQ6UXI7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VITQ6UXI7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VITQ6UXI7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VITQ6UXI7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VITQ6UXI7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VITQ6UXI7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VITQ6UXI7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VITQ6UXI7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
VITQ6UXI7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VITQ6UXI7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
VITQ6UXI7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VITQ6UXI7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VITQ6UXI7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VITQ6UXI7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VITQ6UXI7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VITQ6UXI7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VITQ6UXI7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VITQ6UXI7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VITQ6UXI7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
VITQ6UXI7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VITQ6UXI7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VITQ6UXI7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VITQ6UXI7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VITQ6UXI7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VITQ6UXI7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VITQ6UXI7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VITQ6UXI7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VITQ6UXI7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VITQ6UXI7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VITQ6UXI7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VITQ6UXI7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VITQ6UXI7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms