Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWU4

C6orf89, Bombesin receptor-activated protein C6orf89, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf89Q6UWU4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C6orf89Q6UWU4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C6orf89Q6UWU4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
C6orf89Q6UWU4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C6orf89Q6UWU4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C6orf89Q6UWU4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C6orf89Q6UWU4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C6orf89Q6UWU4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C6orf89Q6UWU4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
C6orf89Q6UWU4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C6orf89Q6UWU4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C6orf89Q6UWU4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C6orf89Q6UWU4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C6orf89Q6UWU4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C6orf89Q6UWU4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C6orf89Q6UWU4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C6orf89Q6UWU4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C6orf89Q6UWU4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C6orf89Q6UWU4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C6orf89Q6UWU4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C6orf89Q6UWU4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C6orf89Q6UWU4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C6orf89Q6UWU4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C6orf89Q6UWU4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C6orf89Q6UWU4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C6orf89Q6UWU4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C6orf89Q6UWU4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C6orf89Q6UWU4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
C6orf89Q6UWU4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C6orf89Q6UWU4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C6orf89Q6UWU4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C6orf89Q6UWU4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C6orf89Q6UWU4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
C6orf89Q6UWU4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
C6orf89Q6UWU4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
C6orf89Q6UWU4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C6orf89Q6UWU4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C6orf89Q6UWU4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
C6orf89Q6UWU4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C6orf89Q6UWU4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C6orf89Q6UWU4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C6orf89Q6UWU4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C6orf89Q6UWU4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C6orf89Q6UWU4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C6orf89Q6UWU4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
C6orf89Q6UWU4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C6orf89Q6UWU4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C6orf89Q6UWU4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C6orf89Q6UWU4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C6orf89Q6UWU4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C6orf89Q6UWU4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C6orf89Q6UWU4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C6orf89Q6UWU4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C6orf89Q6UWU4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C6orf89Q6UWU4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C6orf89Q6UWU4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C6orf89Q6UWU4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C6orf89Q6UWU4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C6orf89Q6UWU4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
C6orf89Q6UWU4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
C6orf89Q6UWU4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
C6orf89Q6UWU4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
C6orf89Q6UWU4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C6orf89Q6UWU4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C6orf89Q6UWU4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C6orf89Q6UWU4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C6orf89Q6UWU4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C6orf89Q6UWU4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
C6orf89Q6UWU4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C6orf89Q6UWU4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C6orf89Q6UWU4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C6orf89Q6UWU4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C6orf89Q6UWU4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C6orf89Q6UWU4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C6orf89Q6UWU4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C6orf89Q6UWU4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C6orf89Q6UWU4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
C6orf89Q6UWU4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C6orf89Q6UWU4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C6orf89Q6UWU4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C6orf89Q6UWU4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C6orf89Q6UWU4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C6orf89Q6UWU4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C6orf89Q6UWU4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C6orf89Q6UWU4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C6orf89Q6UWU4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C6orf89Q6UWU4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C6orf89Q6UWU4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C6orf89Q6UWU4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C6orf89Q6UWU4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C6orf89Q6UWU4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C6orf89Q6UWU4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C6orf89Q6UWU4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
C6orf89Q6UWU4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
C6orf89Q6UWU4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C6orf89Q6UWU4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C6orf89Q6UWU4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C6orf89Q6UWU4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C6orf89Q6UWU4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C6orf89Q6UWU4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms