Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWJ1

TMCO3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 677 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO3Q6UWJ1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMCO3Q6UWJ1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMCO3Q6UWJ1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMCO3Q6UWJ1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMCO3Q6UWJ1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMCO3Q6UWJ1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMCO3Q6UWJ1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMCO3Q6UWJ1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMCO3Q6UWJ1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMCO3Q6UWJ1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMCO3Q6UWJ1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMCO3Q6UWJ1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
TMCO3Q6UWJ1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMCO3Q6UWJ1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMCO3Q6UWJ1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMCO3Q6UWJ1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMCO3Q6UWJ1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMCO3Q6UWJ1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMCO3Q6UWJ1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMCO3Q6UWJ1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMCO3Q6UWJ1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TMCO3Q6UWJ1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMCO3Q6UWJ1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMCO3Q6UWJ1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMCO3Q6UWJ1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMCO3Q6UWJ1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMCO3Q6UWJ1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMCO3Q6UWJ1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TMCO3Q6UWJ1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMCO3Q6UWJ1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMCO3Q6UWJ1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMCO3Q6UWJ1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMCO3Q6UWJ1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMCO3Q6UWJ1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMCO3Q6UWJ1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMCO3Q6UWJ1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMCO3Q6UWJ1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
TMCO3Q6UWJ1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMCO3Q6UWJ1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMCO3Q6UWJ1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
TMCO3Q6UWJ1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
TMCO3Q6UWJ1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMCO3Q6UWJ1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMCO3Q6UWJ1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMCO3Q6UWJ1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMCO3Q6UWJ1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMCO3Q6UWJ1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMCO3Q6UWJ1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMCO3Q6UWJ1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMCO3Q6UWJ1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMCO3Q6UWJ1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMCO3Q6UWJ1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
TMCO3Q6UWJ1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMCO3Q6UWJ1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMCO3Q6UWJ1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMCO3Q6UWJ1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMCO3Q6UWJ1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMCO3Q6UWJ1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMCO3Q6UWJ1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMCO3Q6UWJ1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMCO3Q6UWJ1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TMCO3Q6UWJ1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMCO3Q6UWJ1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMCO3Q6UWJ1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMCO3Q6UWJ1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMCO3Q6UWJ1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMCO3Q6UWJ1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMCO3Q6UWJ1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMCO3Q6UWJ1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMCO3Q6UWJ1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMCO3Q6UWJ1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TMCO3Q6UWJ1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TMCO3Q6UWJ1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMCO3Q6UWJ1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMCO3Q6UWJ1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMCO3Q6UWJ1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMCO3Q6UWJ1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMCO3Q6UWJ1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMCO3Q6UWJ1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMCO3Q6UWJ1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMCO3Q6UWJ1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMCO3Q6UWJ1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMCO3Q6UWJ1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMCO3Q6UWJ1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMCO3Q6UWJ1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMCO3Q6UWJ1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMCO3Q6UWJ1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMCO3Q6UWJ1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMCO3Q6UWJ1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMCO3Q6UWJ1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMCO3Q6UWJ1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMCO3Q6UWJ1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
TMCO3Q6UWJ1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMCO3Q6UWJ1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMCO3Q6UWJ1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMCO3Q6UWJ1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMCO3Q6UWJ1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMCO3Q6UWJ1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMCO3Q6UWJ1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
TMCO3Q6UWJ1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
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