Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIF2

SYCE2, Synaptonemal complex central element protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE2Q6PIF2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYCE2Q6PIF2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYCE2Q6PIF2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYCE2Q6PIF2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYCE2Q6PIF2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SYCE2Q6PIF2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYCE2Q6PIF2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SYCE2Q6PIF2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYCE2Q6PIF2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYCE2Q6PIF2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYCE2Q6PIF2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYCE2Q6PIF2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYCE2Q6PIF2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SYCE2Q6PIF2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYCE2Q6PIF2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYCE2Q6PIF2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYCE2Q6PIF2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYCE2Q6PIF2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SYCE2Q6PIF2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYCE2Q6PIF2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYCE2Q6PIF2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYCE2Q6PIF2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SYCE2Q6PIF2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SYCE2Q6PIF2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYCE2Q6PIF2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYCE2Q6PIF2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYCE2Q6PIF2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYCE2Q6PIF2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYCE2Q6PIF2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYCE2Q6PIF2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYCE2Q6PIF2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SYCE2Q6PIF2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYCE2Q6PIF2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYCE2Q6PIF2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SYCE2Q6PIF2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYCE2Q6PIF2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SYCE2Q6PIF2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYCE2Q6PIF2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYCE2Q6PIF2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYCE2Q6PIF2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYCE2Q6PIF2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYCE2Q6PIF2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYCE2Q6PIF2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYCE2Q6PIF2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYCE2Q6PIF2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYCE2Q6PIF2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYCE2Q6PIF2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SYCE2Q6PIF2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYCE2Q6PIF2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYCE2Q6PIF2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYCE2Q6PIF2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYCE2Q6PIF2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYCE2Q6PIF2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYCE2Q6PIF2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYCE2Q6PIF2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYCE2Q6PIF2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYCE2Q6PIF2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYCE2Q6PIF2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYCE2Q6PIF2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYCE2Q6PIF2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYCE2Q6PIF2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYCE2Q6PIF2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYCE2Q6PIF2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYCE2Q6PIF2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYCE2Q6PIF2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYCE2Q6PIF2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYCE2Q6PIF2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYCE2Q6PIF2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYCE2Q6PIF2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYCE2Q6PIF2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYCE2Q6PIF2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYCE2Q6PIF2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYCE2Q6PIF2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYCE2Q6PIF2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYCE2Q6PIF2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYCE2Q6PIF2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYCE2Q6PIF2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYCE2Q6PIF2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SYCE2Q6PIF2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYCE2Q6PIF2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYCE2Q6PIF2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYCE2Q6PIF2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYCE2Q6PIF2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYCE2Q6PIF2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYCE2Q6PIF2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYCE2Q6PIF2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYCE2Q6PIF2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYCE2Q6PIF2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYCE2Q6PIF2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYCE2Q6PIF2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYCE2Q6PIF2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYCE2Q6PIF2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYCE2Q6PIF2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYCE2Q6PIF2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYCE2Q6PIF2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYCE2Q6PIF2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYCE2Q6PIF2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SYCE2Q6PIF2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SYCE2Q6PIF2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SYCE2Q6PIF2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms