Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2E9

EDC4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC4Q6P2E9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
EDC4Q6P2E9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
EDC4Q6P2E9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
EDC4Q6P2E9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
EDC4Q6P2E9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
EDC4Q6P2E9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC33.98■■■■□ 3.03
EDC4Q6P2E9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
EDC4Q6P2E9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
EDC4Q6P2E9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
EDC4Q6P2E9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
EDC4Q6P2E9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
EDC4Q6P2E9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
EDC4Q6P2E9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
EDC4Q6P2E9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
EDC4Q6P2E9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
EDC4Q6P2E9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
EDC4Q6P2E9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
EDC4Q6P2E9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
EDC4Q6P2E9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
EDC4Q6P2E9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
EDC4Q6P2E9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
EDC4Q6P2E9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
EDC4Q6P2E9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
EDC4Q6P2E9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC33.92■■■■□ 3.02
EDC4Q6P2E9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
EDC4Q6P2E9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
EDC4Q6P2E9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
EDC4Q6P2E9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
EDC4Q6P2E9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
EDC4Q6P2E9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
EDC4Q6P2E9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
EDC4Q6P2E9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
EDC4Q6P2E9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
EDC4Q6P2E9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
EDC4Q6P2E9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
EDC4Q6P2E9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
EDC4Q6P2E9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
EDC4Q6P2E9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
EDC4Q6P2E9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
EDC4Q6P2E9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
EDC4Q6P2E9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
EDC4Q6P2E9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC33.87■■■■□ 3.01
EDC4Q6P2E9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
EDC4Q6P2E9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
EDC4Q6P2E9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
EDC4Q6P2E9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
EDC4Q6P2E9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
EDC4Q6P2E9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
EDC4Q6P2E9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
EDC4Q6P2E9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC33.85■■■■□ 3.01
EDC4Q6P2E9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
EDC4Q6P2E9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
EDC4Q6P2E9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
EDC4Q6P2E9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
EDC4Q6P2E9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
EDC4Q6P2E9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
EDC4Q6P2E9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
EDC4Q6P2E9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
EDC4Q6P2E9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
EDC4Q6P2E9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
EDC4Q6P2E9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
EDC4Q6P2E9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
EDC4Q6P2E9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
EDC4Q6P2E9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC33.82■■■■□ 3
EDC4Q6P2E9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
EDC4Q6P2E9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
EDC4Q6P2E9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC33.81■■■■□ 3
EDC4Q6P2E9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.8■■■■□ 3
EDC4Q6P2E9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
EDC4Q6P2E9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
EDC4Q6P2E9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
EDC4Q6P2E9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
EDC4Q6P2E9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC33.8■■■■□ 3
EDC4Q6P2E9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
EDC4Q6P2E9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
EDC4Q6P2E9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
EDC4Q6P2E9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
EDC4Q6P2E9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
EDC4Q6P2E9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
EDC4Q6P2E9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC33.79■■■■□ 3
EDC4Q6P2E9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
EDC4Q6P2E9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
EDC4Q6P2E9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
EDC4Q6P2E9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
EDC4Q6P2E9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
EDC4Q6P2E9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
EDC4Q6P2E9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
EDC4Q6P2E9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
EDC4Q6P2E9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
EDC4Q6P2E9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
EDC4Q6P2E9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
EDC4Q6P2E9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
EDC4Q6P2E9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
EDC4Q6P2E9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
EDC4Q6P2E9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
EDC4Q6P2E9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
EDC4Q6P2E9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
EDC4Q6P2E9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
EDC4Q6P2E9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
EDC4Q6P2E9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.6 ms