Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1K1

SLC48A1, Heme transporter HRG1, humanhuman

Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC48A1Q6P1K1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC48A1Q6P1K1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC48A1Q6P1K1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC48A1Q6P1K1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC48A1Q6P1K1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC48A1Q6P1K1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC48A1Q6P1K1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC48A1Q6P1K1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC48A1Q6P1K1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC48A1Q6P1K1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC48A1Q6P1K1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC48A1Q6P1K1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC48A1Q6P1K1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC48A1Q6P1K1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC48A1Q6P1K1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC48A1Q6P1K1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC48A1Q6P1K1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC48A1Q6P1K1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC48A1Q6P1K1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC48A1Q6P1K1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC48A1Q6P1K1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC48A1Q6P1K1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC48A1Q6P1K1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC48A1Q6P1K1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC48A1Q6P1K1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC48A1Q6P1K1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC48A1Q6P1K1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC48A1Q6P1K1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC48A1Q6P1K1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC48A1Q6P1K1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC48A1Q6P1K1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC48A1Q6P1K1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC48A1Q6P1K1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC48A1Q6P1K1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC48A1Q6P1K1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC48A1Q6P1K1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC48A1Q6P1K1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC48A1Q6P1K1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC48A1Q6P1K1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC48A1Q6P1K1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC48A1Q6P1K1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC48A1Q6P1K1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC48A1Q6P1K1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC48A1Q6P1K1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC48A1Q6P1K1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC48A1Q6P1K1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC48A1Q6P1K1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC48A1Q6P1K1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC48A1Q6P1K1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC48A1Q6P1K1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC48A1Q6P1K1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC48A1Q6P1K1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC48A1Q6P1K1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC48A1Q6P1K1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC48A1Q6P1K1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC48A1Q6P1K1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC48A1Q6P1K1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC48A1Q6P1K1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC48A1Q6P1K1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC48A1Q6P1K1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC48A1Q6P1K1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC48A1Q6P1K1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC48A1Q6P1K1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC48A1Q6P1K1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC48A1Q6P1K1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC48A1Q6P1K1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC48A1Q6P1K1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC48A1Q6P1K1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC48A1Q6P1K1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC48A1Q6P1K1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC48A1Q6P1K1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC48A1Q6P1K1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC48A1Q6P1K1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC48A1Q6P1K1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC48A1Q6P1K1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC48A1Q6P1K1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC48A1Q6P1K1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC48A1Q6P1K1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC48A1Q6P1K1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC48A1Q6P1K1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC48A1Q6P1K1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC48A1Q6P1K1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC48A1Q6P1K1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC48A1Q6P1K1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC48A1Q6P1K1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC48A1Q6P1K1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC48A1Q6P1K1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC48A1Q6P1K1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC48A1Q6P1K1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC48A1Q6P1K1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC48A1Q6P1K1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC48A1Q6P1K1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC48A1Q6P1K1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC48A1Q6P1K1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC48A1Q6P1K1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC48A1Q6P1K1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC48A1Q6P1K1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC48A1Q6P1K1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC48A1Q6P1K1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC48A1Q6P1K1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.7 ms