Protein–RNA interactions for Protein: Q6NYC8

PPP1R18, Phostensin, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R18Q6NYC8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PPP1R18Q6NYC8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PPP1R18Q6NYC8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PPP1R18Q6NYC8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PPP1R18Q6NYC8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
PPP1R18Q6NYC8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PPP1R18Q6NYC8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PPP1R18Q6NYC8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PPP1R18Q6NYC8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PPP1R18Q6NYC8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PPP1R18Q6NYC8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PPP1R18Q6NYC8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PPP1R18Q6NYC8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PPP1R18Q6NYC8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PPP1R18Q6NYC8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
PPP1R18Q6NYC8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PPP1R18Q6NYC8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PPP1R18Q6NYC8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PPP1R18Q6NYC8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PPP1R18Q6NYC8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PPP1R18Q6NYC8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PPP1R18Q6NYC8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PPP1R18Q6NYC8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PPP1R18Q6NYC8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PPP1R18Q6NYC8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PPP1R18Q6NYC8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
PPP1R18Q6NYC8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PPP1R18Q6NYC8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PPP1R18Q6NYC8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PPP1R18Q6NYC8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PPP1R18Q6NYC8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PPP1R18Q6NYC8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PPP1R18Q6NYC8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PPP1R18Q6NYC8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PPP1R18Q6NYC8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PPP1R18Q6NYC8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PPP1R18Q6NYC8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PPP1R18Q6NYC8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PPP1R18Q6NYC8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PPP1R18Q6NYC8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PPP1R18Q6NYC8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PPP1R18Q6NYC8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PPP1R18Q6NYC8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
PPP1R18Q6NYC8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PPP1R18Q6NYC8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PPP1R18Q6NYC8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PPP1R18Q6NYC8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PPP1R18Q6NYC8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PPP1R18Q6NYC8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PPP1R18Q6NYC8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PPP1R18Q6NYC8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PPP1R18Q6NYC8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PPP1R18Q6NYC8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PPP1R18Q6NYC8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PPP1R18Q6NYC8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PPP1R18Q6NYC8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PPP1R18Q6NYC8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PPP1R18Q6NYC8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
PPP1R18Q6NYC8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PPP1R18Q6NYC8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PPP1R18Q6NYC8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PPP1R18Q6NYC8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PPP1R18Q6NYC8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PPP1R18Q6NYC8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PPP1R18Q6NYC8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PPP1R18Q6NYC8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PPP1R18Q6NYC8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PPP1R18Q6NYC8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PPP1R18Q6NYC8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PPP1R18Q6NYC8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PPP1R18Q6NYC8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PPP1R18Q6NYC8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PPP1R18Q6NYC8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
PPP1R18Q6NYC8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PPP1R18Q6NYC8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PPP1R18Q6NYC8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PPP1R18Q6NYC8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
PPP1R18Q6NYC8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PPP1R18Q6NYC8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PPP1R18Q6NYC8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PPP1R18Q6NYC8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PPP1R18Q6NYC8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PPP1R18Q6NYC8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PPP1R18Q6NYC8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PPP1R18Q6NYC8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PPP1R18Q6NYC8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PPP1R18Q6NYC8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PPP1R18Q6NYC8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PPP1R18Q6NYC8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PPP1R18Q6NYC8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PPP1R18Q6NYC8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PPP1R18Q6NYC8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PPP1R18Q6NYC8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PPP1R18Q6NYC8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
PPP1R18Q6NYC8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PPP1R18Q6NYC8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PPP1R18Q6NYC8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
PPP1R18Q6NYC8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PPP1R18Q6NYC8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PPP1R18Q6NYC8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms